137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4166 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4166  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
390 aa  793    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1999  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3274  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 
416 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.93 
 
 
414 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
311 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
637 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
681 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
364 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.28 
 
 
632 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
472 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
635 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
635 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 
4489 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
565 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
714 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
611 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.9 
 
 
561 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
2262 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.65 
 
 
714 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
452 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
543 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
639 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
637 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  28.8 
 
 
561 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  33 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
638 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
2262 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
685 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1499  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
329 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00502134  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
3301 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
399 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
3145 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
4079 aa  50.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1301  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
250 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0926  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
148 aa  49.7  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.99 
 
 
689 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
620 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
245 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.71 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
486 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
597 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 
636 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
3035 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.71 
 
 
363 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
265 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
583 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
878 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.3 
 
 
620 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 
1737 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
3172 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
448 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.65 
 
 
1694 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.55 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
274 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.88 
 
 
560 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
1827 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2655  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
250 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
329 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2559  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 
250 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
909 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
1094 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.98 
 
 
725 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
274 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
466 aa  47  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
673 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
612 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  25.88 
 
 
295 aa  46.6  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
612 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 
544 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.91 
 
 
274 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  28.47 
 
 
473 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  26.92 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.22 
 
 
875 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
688 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2298  tetratricopeptide TPR_2  50 
 
 
664 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
1486 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.07 
 
 
865 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.76 
 
 
1274 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
1069 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
547 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.06 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  28.65 
 
 
566 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  21.88 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.69 
 
 
795 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.02 
 
 
586 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.15 
 
 
1979 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  29.29 
 
 
246 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.09 
 
 
314 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
3560 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.2 
 
 
745 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36889  predicted protein  28.7 
 
 
209 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00688126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
750 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
1178 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
824 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
221 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>