More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8289 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 853 aa  1625    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  47.32 
 
 		 806 aa  604  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  38.52 
 
 		 843 aa  465  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  37.79 
 
 		 842 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  37.69 
 
 		 834 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  36.55 
 
 		 847 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  38.17 
 
 		 848 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  34.79 
 
 		 852 aa  344  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  34.8 
 
 		 856 aa  336  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  35.42 
 
 		 849 aa  327  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  34.82 
 
 		 845 aa  327  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  33.89 
 
 		 853 aa  326  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  34.76 
 
 		 859 aa  320  7.999999999999999e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  36.03 
 
 		 849 aa  317  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  34.14 
 
 		 836 aa  307  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  32.94 
 
 		 855 aa  304  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 		 861 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  35.11 
 
 		 853 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  33.3 
 
 		 861 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  31.96 
 
 		 873 aa  269  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  29.84 
 
 		 854 aa  267  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  33.67 
 
 		 873 aa  266  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  32.33 
 
 		 841 aa  257  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  35.64 
 
 		 866 aa  254  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  34.31 
 
 		 857 aa  253  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  33.9 
 
 		 839 aa  242  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  32.28 
 
 		 825 aa  241  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  33.1 
 
 		 838 aa  238  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  34.67 
 
 		 828 aa  217  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  34.1 
 
 		 846 aa  205  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  31.94 
 
 		 855 aa  179  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.33 
 
 		 855 aa  173  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.32 
 
 		 859 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  30.78 
 
 		 930 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  33.06 
 
 		 821 aa  153  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26.23 
 
 		 880 aa  151  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 		 857 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  39.09 
 
 		 871 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.3 
 
 		 835 aa  147  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  26.05 
 
 		 855 aa  140  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  37.73 
 
 		 878 aa  128  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  25.69 
 
 		 897 aa  127  7e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  28.21 
 
 		 852 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.61 
 
 		 851 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  26.63 
 
 		 850 aa  119  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  25.18 
 
 		 849 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.33 
 
 		 850 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 		 855 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.47 
 
 		 863 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  27.07 
 
 		 858 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 		 828 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 		 847 aa  107  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25.98 
 
 		 870 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.31 
 
 		 858 aa  105  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.56 
 
 		 866 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.03 
 
 		 854 aa  104  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.27 
 
 		 807 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 847 aa  98.2  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  29.32 
 
 		 843 aa  97.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.2 
 
 		 857 aa  95.5  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  30.16 
 
 		 801 aa  94.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.01 
 
 		 839 aa  94.4  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 822 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  28.87 
 
 		 838 aa  88.6  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  27.35 
 
 		 822 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 		 857 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  26.29 
 
 		 846 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  20.71 
 
 		 794 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.17 
 
 		 371 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  28.2 
 
 		 822 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 874 aa  78.2  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  21.3 
 
 		 850 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.48 
 
 		 414 aa  77  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  23.72 
 
 		 858 aa  75.1  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  27.43 
 
 		 827 aa  74.3  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  30.66 
 
 		 841 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  25.06 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.99 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  26.79 
 
 		 643 aa  71.2  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  25.94 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  31.54 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  25.06 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0334  protein of unknown function DUF214  27.31 
 
 		 941 aa  68.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.530518  hitchhiker  0.0000549339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  29.84 
 
 		 852 aa  68.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  34.78 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  36.76 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  46.43 
 
 		 738 aa  68.2  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.71 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  22.38 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.94 
 
 		 882 aa  67.8  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  26.07 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  27.03 
 
 		 841 aa  67  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  26.85 
 
 		 381 aa  67.4  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 849 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.65 
 
 		 443 aa  66.6  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  23.77 
 
 		 386 aa  66.6  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 849 aa  65.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 		 845 aa  66.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  26.09 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>