143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7275 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 
624 aa  1238    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  37.13 
 
 
635 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  38.06 
 
 
635 aa  262  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.52 
 
 
656 aa  253  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  34.75 
 
 
663 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  38.01 
 
 
678 aa  223  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  33.39 
 
 
688 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  35.46 
 
 
714 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  44.9 
 
 
1037 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  35.95 
 
 
673 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  35.32 
 
 
667 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  41.11 
 
 
609 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  41.92 
 
 
661 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  43.14 
 
 
976 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.46 
 
 
386 aa  181  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  45.27 
 
 
1073 aa  179  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  39.31 
 
 
998 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  41.52 
 
 
627 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.02 
 
 
871 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.69 
 
 
905 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  40.8 
 
 
1192 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.2 
 
 
1412 aa  163  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  39.51 
 
 
554 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  40.43 
 
 
643 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  36.55 
 
 
848 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  39.7 
 
 
442 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.36 
 
 
847 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.39 
 
 
464 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35 
 
 
885 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.12 
 
 
684 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  36.5 
 
 
682 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.48 
 
 
510 aa  147  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35 
 
 
706 aa  142  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  35.57 
 
 
589 aa  137  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.28 
 
 
769 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  33.64 
 
 
962 aa  134  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  33.12 
 
 
1312 aa  131  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  32.7 
 
 
1452 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.34 
 
 
860 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  32.36 
 
 
1550 aa  127  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  32.82 
 
 
1045 aa  123  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.48 
 
 
2884 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  29.49 
 
 
600 aa  120  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  34.87 
 
 
688 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.12 
 
 
719 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.39 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.87 
 
 
326 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.41 
 
 
619 aa  111  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.67 
 
 
600 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.41 
 
 
543 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  37.98 
 
 
841 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  28.71 
 
 
570 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  27.3 
 
 
600 aa  104  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  28.2 
 
 
538 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.23 
 
 
649 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  28.81 
 
 
637 aa  99.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.76 
 
 
600 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.67 
 
 
530 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  27.18 
 
 
640 aa  96.3  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.6 
 
 
795 aa  91.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  29.1 
 
 
1916 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.47 
 
 
475 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.77 
 
 
749 aa  75.1  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.13 
 
 
1059 aa  75.1  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  29.86 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.86 
 
 
342 aa  67  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  30.8 
 
 
435 aa  64.7  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  28.3 
 
 
442 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.01 
 
 
444 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  28.65 
 
 
440 aa  61.2  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.72 
 
 
407 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  28.27 
 
 
833 aa  59.7  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  35.34 
 
 
551 aa  59.7  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  27.71 
 
 
461 aa  57.4  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  29.11 
 
 
449 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  33.07 
 
 
437 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3384  WD40 domain protein beta Propeller  24.83 
 
 
398 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.749473  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  33.07 
 
 
434 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  34.11 
 
 
434 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  25.89 
 
 
439 aa  53.9  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.24 
 
 
407 aa  53.9  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  25 
 
 
1167 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1588  hypothetical protein  27.04 
 
 
367 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.56 
 
 
442 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  32.28 
 
 
434 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.27 
 
 
442 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  28.12 
 
 
419 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.46 
 
 
430 aa  52  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  25.91 
 
 
441 aa  52  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  27.03 
 
 
434 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  27.27 
 
 
425 aa  51.6  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1561  WD40 domain-containing protein  26.96 
 
 
375 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  28.65 
 
 
443 aa  51.2  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  26.84 
 
 
434 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  27.51 
 
 
427 aa  50.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  26.96 
 
 
717 aa  50.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  26.8 
 
 
444 aa  50.4  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  43.33 
 
 
298 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  35.79 
 
 
297 aa  49.3  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  30.33 
 
 
444 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>