More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0482 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0482  serine protease  100 
 
 		 423 aa  880    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4019  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.35 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3093  trypsin-like serine proteases typically periplasmic  38.54 
 
 		 468 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0647718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4520  hypothetical protein  34.14 
 
 		 448 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0422  trypsin-like serine protease  31.46 
 
 		 471 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  33.87 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  31.92 
 
 		 475 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  34.76 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  32.95 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.06 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  29.22 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.06 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  35.06 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.47 
 
 		 674 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  33.93 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  35.98 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  33.33 
 
 		 523 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  35.63 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  35.06 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  30.73 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  30.73 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  34.48 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  35.06 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  33.94 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  31.36 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  32.93 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1306  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.09 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  34.57 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  33.17 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  31.95 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  29.95 
 
 		 501 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  30.95 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.37 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  33.73 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  32.35 
 
 		 504 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  34.5 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  33.52 
 
 		 473 aa  79.7  0.00000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  32.7 
 
 		 527 aa  79.7  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3980  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.09 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  35.8 
 
 		 464 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  33.73 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  29.41 
 
 		 500 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  29.9 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  32 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  31.98 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  31.82 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  30.91 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  35.19 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  35 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  31.45 
 
 		 528 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  34.57 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  32.3 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  30.77 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  30.36 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  32.3 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  31.45 
 
 		 528 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  30.18 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  32.08 
 
 		 523 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  30.18 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  27.75 
 
 		 528 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  33.93 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  34.71 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.24 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4479  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.82 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  34.15 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  29.61 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  34.57 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 525 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  33.14 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  28.5 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  29.17 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  27.73 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  32.93 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.73 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  32.54 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  32.02 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  33.33 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  31.09 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  31.29 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  30.4 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  26.94 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  28.37 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  32.69 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.79 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.34 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  30.46 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  32.72 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  31.61 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.48 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  33.14 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  36.14 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  30.18 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  32.72 
 
 		 487 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  32.79 
 
 		 518 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  32.14 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  33.53 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  29.82 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  33.92 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>