More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4520 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4520  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  912    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0422  trypsin-like serine protease  37.59 
 
 		 471 aa  266  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0482  serine protease  34.14 
 
 		 423 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4019  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.08 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3093  trypsin-like serine proteases typically periplasmic  30.56 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0647718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  38.73 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  35 
 
 		 513 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.3 
 
 		 318 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.43 
 
 		 318 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  32.37 
 
 		 482 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  35.8 
 
 		 458 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  36.42 
 
 		 464 aa  93.6  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  32.64 
 
 		 453 aa  93.2  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  35.23 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  34.05 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  35.39 
 
 		 466 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  34.08 
 
 		 462 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  32.02 
 
 		 481 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  35.53 
 
 		 497 aa  90.5  5e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.51 
 
 		 410 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  33.48 
 
 		 464 aa  90.1  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  34.17 
 
 		 308 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  36.26 
 
 		 464 aa  90.1  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  33.79 
 
 		 491 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32 
 
 		 417 aa  89.7  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  36.02 
 
 		 348 aa  89.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  32.6 
 
 		 505 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  36.26 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  31.08 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  32.89 
 
 		 520 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  35.2 
 
 		 528 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  35.26 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  34.43 
 
 		 526 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  35.96 
 
 		 527 aa  87.8  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.26 
 
 		 318 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  33.49 
 
 		 491 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  32.79 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.26 
 
 		 319 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  32.42 
 
 		 472 aa  87  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  31.02 
 
 		 402 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 480 aa  87  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  32.16 
 
 		 507 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  31.02 
 
 		 402 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  33.7 
 
 		 402 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  31.53 
 
 		 385 aa  86.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.8 
 
 		 569 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3867  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.74 
 
 		 433 aa  86.7  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  35.2 
 
 		 520 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  32.74 
 
 		 499 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.66 
 
 		 351 aa  86.7  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  30.91 
 
 		 476 aa  86.3  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  35.75 
 
 		 525 aa  86.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  34.34 
 
 		 264 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  32.74 
 
 		 499 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  34.55 
 
 		 527 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  34.1 
 
 		 485 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  32.04 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.2 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  31.46 
 
 		 443 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  31.84 
 
 		 318 aa  86.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  34.81 
 
 		 523 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  30.77 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  34.44 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  31.61 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  29.82 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  35.39 
 
 		 528 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.05 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.69 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.71 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  31.87 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  33.7 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  32.3 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  34.03 
 
 		 527 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  31.87 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  31.3 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  32.3 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.96 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  32.77 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  31.3 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  32.39 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  32.3 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  32.18 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  32.3 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  30.05 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  32.3 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.05 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  30.56 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.6 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  31.64 
 
 		 518 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  34.3 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  30.6 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  29.69 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  28.72 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  33.16 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  31.54 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  29.63 
 
 		 476 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  30.6 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  34.76 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  31.42 
 
 		 502 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  31.58 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>