More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3093 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3093  trypsin-like serine proteases typically periplasmic  100 
 
 		 468 aa  972    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0647718  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0482  serine protease  38.54 
 
 		 423 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4019  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.41 
 
 		 445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4520  hypothetical protein  30.56 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0422  trypsin-like serine protease  29.37 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  31.63 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  32.34 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.82 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.51 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  32.78 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  32.02 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  34.1 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  30.22 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  28.89 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  31.46 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  30.39 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  31.58 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.24 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  31.77 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  30.46 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  33.67 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  32.2 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0718  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.55 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  33.14 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  30.51 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  32.07 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  28.2 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  31.69 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  30.51 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.63 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.473362  hitchhiker  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  31.82 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.99 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  29.55 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.69 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  33.14 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.23 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.15 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  26.67 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  27.76 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  29.12 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  29.55 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.36 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  33.52 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  28.15 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  32.96 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.29 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0016  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.46 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  28.77 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  28.46 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3980  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.78 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  31.28 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1248  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.11 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.490271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  29.27 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  29.57 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.09 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1456  PDZ/DHR/GLGF  27.19 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  29.73 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  29.31 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  28.32 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  29.41 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  29.27 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01581  serine protease  27.19 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.52 
 
 		 384 aa  69.7  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.9 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  31.71 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  27.34 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  32.54 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  29.27 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.71 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  29.06 
 
 		 518 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  32.16 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  29.55 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  30.41 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  33.7 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  34.07 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  28 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  29.39 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.91 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.9 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  27.27 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  29.38 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  29.55 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  33.71 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  29.71 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  26.97 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  30.41 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.71 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  30.93 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.73 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  30.11 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.9 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  33.33 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.44 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1154  2-alkenal reductase  30.37 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479509 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  30.43 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  31.15 
 
 		 497 aa  67.4  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  34.07 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  31.68 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  31.82 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>