More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3980 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3980  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 369 aa  756    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  42.86 
 
 		 492 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  41.67 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  41.42 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  35.8 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  41.42 
 
 		 474 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  41.42 
 
 		 474 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  35.81 
 
 		 473 aa  106  7e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  40.23 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  33.97 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  38.55 
 
 		 497 aa  104  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  36.45 
 
 		 480 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  38.37 
 
 		 466 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.92 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  39.31 
 
 		 476 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  36.61 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  38.74 
 
 		 510 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.55 
 
 		 453 aa  100  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.93 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  38.07 
 
 		 503 aa  99.8  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  39.6 
 
 		 466 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  37.65 
 
 		 476 aa  99.4  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  33.19 
 
 		 483 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  33.19 
 
 		 483 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.07 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  35.84 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  39.11 
 
 		 466 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.83 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.87 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  36.26 
 
 		 485 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  38.73 
 
 		 453 aa  97.4  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  36.09 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  35.59 
 
 		 458 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  35.59 
 
 		 457 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  37.65 
 
 		 485 aa  97.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  36.7 
 
 		 471 aa  96.7  5e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  38.15 
 
 		 411 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  37.79 
 
 		 500 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  39.52 
 
 		 471 aa  96.3  7e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  33.89 
 
 		 459 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.29 
 
 		 476 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  37.43 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  34.43 
 
 		 459 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  34.43 
 
 		 459 aa  95.9  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.29 
 
 		 476 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  34.83 
 
 		 464 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  35.29 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  38.18 
 
 		 508 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  38.15 
 
 		 528 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  37.65 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  36.69 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  34.71 
 
 		 461 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3074  protease DegS  38.55 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.940129  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  37.28 
 
 		 501 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  37.87 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  35.29 
 
 		 461 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  37.28 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  37.17 
 
 		 525 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  37.28 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.63 
 
 		 428 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  35.39 
 
 		 464 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.05 
 
 		 384 aa  93.2  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  37.14 
 
 		 471 aa  93.2  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  36.57 
 
 		 425 aa  93.2  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  39.29 
 
 		 498 aa  93.2  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  36.47 
 
 		 464 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  32.49 
 
 		 442 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  35.22 
 
 		 527 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  37.64 
 
 		 386 aa  92.8  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  39.29 
 
 		 373 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  37.58 
 
 		 524 aa  92.8  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  35.71 
 
 		 488 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  40.35 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  36.09 
 
 		 500 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  35.33 
 
 		 483 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  36.69 
 
 		 501 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  40 
 
 		 383 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.4 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  37.78 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.87 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  38.36 
 
 		 522 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2412  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.48 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  38.1 
 
 		 501 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  35.71 
 
 		 488 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  32.91 
 
 		 483 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  34.27 
 
 		 420 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  32.17 
 
 		 476 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  39.52 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  38.27 
 
 		 523 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  34.78 
 
 		 527 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  38.27 
 
 		 524 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  37.79 
 
 		 465 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  34.05 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  34.05 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.18 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.95 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  31.23 
 
 		 506 aa  90.9  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  36.42 
 
 		 485 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  34.87 
 
 		 475 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>