More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4019 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4019  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 445 aa  914    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0482  serine protease  50.35 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3093  trypsin-like serine proteases typically periplasmic  36.41 
 
 		 468 aa  289  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0647718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0422  trypsin-like serine protease  35.37 
 
 		 471 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4520  hypothetical protein  34.65 
 
 		 448 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.8 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  29.24 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  32.95 
 
 		 504 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 471 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  28.32 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0739  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.73 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  33.95 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  35.71 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  35.71 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  29.8 
 
 		 453 aa  76.3  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  34.76 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  34.57 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  32.75 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.54 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1248  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.490271 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  29.61 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.37 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  35.12 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  28.82 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  31.43 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.64 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  29.74 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  33.53 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  32.56 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  33.14 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  33.13 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  32.3 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  30.86 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  30.86 
 
 		 503 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  30.86 
 
 		 503 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  32.92 
 
 		 485 aa  73.2  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  32.95 
 
 		 498 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  33.14 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2484  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.55 
 
 		 353 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  26.18 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  31.46 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  28.65 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  32.53 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  30.23 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.5 
 
 		 288 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.473362  hitchhiker  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  30.73 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  32.75 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  31.28 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  34.32 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  31.55 
 
 		 528 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  31.31 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  30.36 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  31.9 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  31.64 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  29.71 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  30.06 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  29.65 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  30.28 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  32.93 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  31.25 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  29.82 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.1 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.26 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  32.74 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  28.65 
 
 		 772 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1064  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.1 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12621  hypothetical protein  31.41 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.1 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  32.16 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  31.1 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  29.32 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  31.33 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  29.65 
 
 		 583 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4479  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.24 
 
 		 307 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  30.29 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  30.39 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  29.82 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  32.07 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  34.34 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  29.55 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  29.48 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  31.76 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  31.64 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  34.5 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  33.33 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.98 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  29.7 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  30.68 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  32.61 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.72 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  28.9 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  30.77 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  29.31 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  29.67 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  26.67 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.34 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  32.02 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  25.25 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>