More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ01000 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  100 
 
 		 407 aa  831    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  76.35 
 
 		 402 aa  621  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  76.03 
 
 		 389 aa  587  1e-166  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  73.98 
 
 		 398 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  71.43 
 
 		 403 aa  564  1e-160  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  48.11 
 
 		 408 aa  350  2e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  55.16 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  46.17 
 
 		 405 aa  347  3e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  52.14 
 
 		 404 aa  346  3e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  49.16 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  49.28 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  45.5 
 
 		 412 aa  338  8e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  45.08 
 
 		 412 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  46.62 
 
 		 447 aa  335  7e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  52.01 
 
 		 446 aa  333  2e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  49.43 
 
 		 412 aa  332  5e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  53.82 
 
 		 450 aa  332  8e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  52.58 
 
 		 443 aa  330  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  47.44 
 
 		 421 aa  329  5.0000000000000004e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  43.26 
 
 		 400 aa  329  7e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  44.15 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  46.49 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  44.15 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  42.36 
 
 		 410 aa  327  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  43.88 
 
 		 407 aa  325  9e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  46.2 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  47.21 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  44.2 
 
 		 407 aa  319  5e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  42.45 
 
 		 403 aa  318  7.999999999999999e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  52.2 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  48.01 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  47.43 
 
 		 431 aa  316  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  49.33 
 
 		 405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  42.53 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  47.88 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  51.16 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  54.74 
 
 		 284 aa  311  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  46.26 
 
 		 404 aa  311  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  48.31 
 
 		 390 aa  308  8e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  46.46 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  43.21 
 
 		 405 aa  307  3e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  51.02 
 
 		 464 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  49.65 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  43.94 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  43.94 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  42.45 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  43.31 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  44.07 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  45.14 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  50.53 
 
 		 427 aa  299  7e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  42.58 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  44.31 
 
 		 413 aa  293  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  43.41 
 
 		 387 aa  293  5e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  42.34 
 
 		 407 aa  292  8e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  42.46 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  41.38 
 
 		 389 aa  289  8e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  42.38 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  46.27 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  41.13 
 
 		 414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  43.77 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  40.62 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  47.46 
 
 		 431 aa  278  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  43.99 
 
 		 410 aa  275  8e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  40.81 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.91 
 
 		 723 aa  241  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.64 
 
 		 781 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.51 
 
 		 784 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.68 
 
 		 757 aa  232  9e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.8 
 
 		 754 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46 
 
 		 754 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.28 
 
 		 732 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.68 
 
 		 800 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.66 
 
 		 738 aa  228  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.36 
 
 		 738 aa  228  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  49.15 
 
 		 764 aa  227  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.37 
 
 		 781 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.49 
 
 		 737 aa  226  4e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  48.72 
 
 		 763 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 756 aa  226  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.86 
 
 		 731 aa  226  7e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.97 
 
 		 754 aa  226  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  48.39 
 
 		 699 aa  226  7e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.23 
 
 		 736 aa  225  9e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.01 
 
 		 759 aa  224  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.33 
 
 		 510 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.85 
 
 		 731 aa  224  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.85 
 
 		 719 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.29 
 
 		 754 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  50.43 
 
 		 722 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.84 
 
 		 731 aa  223  3e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.79 
 
 		 737 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.97 
 
 		 697 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  45.98 
 
 		 776 aa  223  7e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.03 
 
 		 760 aa  222  8e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.66 
 
 		 731 aa  222  9e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.93 
 
 		 610 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.35 
 
 		 769 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.93 
 
 		 610 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.35 
 
 		 768 aa  221  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.08 
 
 		 763 aa  221  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>