111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1158 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 539 aa  1086    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  34.72 
 
 		 523 aa  289  7e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  33.27 
 
 		 528 aa  279  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  31.57 
 
 		 565 aa  273  6e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  28.47 
 
 		 535 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  35 
 
 		 772 aa  94  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  26.13 
 
 		 760 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  32.77 
 
 		 1070 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  32.77 
 
 		 1112 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  32.77 
 
 		 1070 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  23.87 
 
 		 766 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  25.44 
 
 		 772 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  25.44 
 
 		 766 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  25.86 
 
 		 760 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  26.91 
 
 		 1266 aa  80.9  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  32.18 
 
 		 765 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  32.18 
 
 		 779 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  24.74 
 
 		 755 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  32.18 
 
 		 542 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  27.8 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  31.35 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  28.96 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  24.77 
 
 		 643 aa  72.8  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  29.65 
 
 		 531 aa  70.1  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.71 
 
 		 1041 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  30.91 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  24.41 
 
 		 995 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  26.45 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  27.09 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  31.37 
 
 		 1344 aa  65.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.2 
 
 		 1107 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1085 aa  64.7  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  25.44 
 
 		 581 aa  64.7  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  32 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  24.28 
 
 		 789 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  24.28 
 
 		 789 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1389 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  25.1 
 
 		 994 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  28.29 
 
 		 2132 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.81 
 
 		 863 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  29.67 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  25.45 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.36 
 
 		 1263 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  25 
 
 		 1088 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  35.33 
 
 		 892 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1052 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  34.06 
 
 		 776 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1351 aa  58.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  21.46 
 
 		 993 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.14 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1744 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  25.91 
 
 		 1290 aa  57.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  21.79 
 
 		 954 aa  57  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  26.38 
 
 		 354 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.75 
 
 		 476 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  29.14 
 
 		 400 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.33 
 
 		 1015 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  21.79 
 
 		 1012 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  28.96 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  26.11 
 
 		 543 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  29.61 
 
 		 581 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  29.05 
 
 		 603 aa  55.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  24.22 
 
 		 858 aa  54.7  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  25.46 
 
 		 399 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  28.22 
 
 		 788 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  28.22 
 
 		 788 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1059 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  27.32 
 
 		 400 aa  54.3  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  29.84 
 
 		 399 aa  54.3  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  28.22 
 
 		 788 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  25.14 
 
 		 284 aa  53.5  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.4 
 
 		 348 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.4 
 
 		 348 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  29.61 
 
 		 972 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  25.97 
 
 		 1335 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  28.12 
 
 		 877 aa  51.6  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  31.3 
 
 		 1011 aa  51.2  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.57 
 
 		 713 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.72 
 
 		 1679 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1831  hypothetical protein  26.63 
 
 		 509 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  26.72 
 
 		 197 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  23.95 
 
 		 1780 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  25.83 
 
 		 307 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 2324 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  31.97 
 
 		 1395 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  30.95 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  30.89 
 
 		 587 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.15 
 
 		 508 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  19.78 
 
 		 421 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  32 
 
 		 279 aa  47  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  26.62 
 
 		 1395 aa  47  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  34.46 
 
 		 484 aa  46.2  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.58 
 
 		 886 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  25.81 
 
 		 318 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  30.87 
 
 		 761 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  26.35 
 
 		 388 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  24.87 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  22.46 
 
 		 765 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  32.31 
 
 		 757 aa  45.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>