213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09188 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  100 
 
 
307 aa  600  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  42.15 
 
 
482 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  41.67 
 
 
1041 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  35.66 
 
 
1263 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  38.89 
 
 
508 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  35.22 
 
 
354 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.36 
 
 
1107 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  40.59 
 
 
416 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  36.4 
 
 
863 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  42.79 
 
 
892 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  37.89 
 
 
1015 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  36.51 
 
 
867 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  37.45 
 
 
937 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  33.78 
 
 
296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  37.45 
 
 
937 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  36.09 
 
 
713 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  37.18 
 
 
757 aa  109  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 
436 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  37.27 
 
 
886 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  39.29 
 
 
448 aa  102  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.64 
 
 
476 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  36.87 
 
 
1024 aa  96.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  38.83 
 
 
761 aa  95.9  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 
445 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  34.78 
 
 
478 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  33.33 
 
 
242 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 
445 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  35.56 
 
 
413 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  37.08 
 
 
204 aa  93.2  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  31.9 
 
 
434 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  35.22 
 
 
1744 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  36.87 
 
 
1749 aa  89.7  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  35.03 
 
 
437 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  34.76 
 
 
447 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  31.5 
 
 
467 aa  89  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  33.33 
 
 
490 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  34.64 
 
 
451 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  38.51 
 
 
291 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  32.8 
 
 
440 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 
439 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  31.89 
 
 
499 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 
440 aa  85.5  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  27.37 
 
 
2132 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  31.47 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  35.2 
 
 
451 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  34.08 
 
 
451 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  31.8 
 
 
464 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  44.44 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.64 
 
 
1344 aa  83.2  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
460 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.84 
 
 
472 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  35.16 
 
 
436 aa  82.4  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 
421 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 
414 aa  82.4  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  33.53 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  31.16 
 
 
484 aa  80.1  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  32.62 
 
 
446 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  34.08 
 
 
451 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 
459 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  33.68 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 
444 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  35.39 
 
 
412 aa  77  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
475 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
453 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  33.17 
 
 
648 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 
432 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  31.25 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
444 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  29.69 
 
 
1088 aa  75.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  33.15 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  34.94 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12909  predicted protein  36.7 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  31.53 
 
 
802 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 
473 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  32.89 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  29.19 
 
 
569 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  33.15 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  33.33 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  31.46 
 
 
2491 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  30.16 
 
 
1395 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  31.05 
 
 
925 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  33.12 
 
 
1481 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  31.02 
 
 
1395 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  30.21 
 
 
685 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.36 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  32.5 
 
 
1481 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  34.69 
 
 
615 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  28.47 
 
 
565 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  26.56 
 
 
447 aa  63.2  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  32.2 
 
 
640 aa  62.8  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>