More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0952 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
146 aa  291  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 
163 aa  95.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
146 aa  60.1  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1367  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000123372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  32.11 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  20 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3369  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0203998  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  21.64 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  19.82 
 
 
154 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  24.63 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
176 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
150 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
176 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  21.14 
 
 
172 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
137 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  25.18 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  21.14 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  26.51 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  22.52 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  21.67 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  30.12 
 
 
191 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  27.61 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  21 
 
 
176 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  22.03 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3588  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  22.12 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  25.97 
 
 
175 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  21.5 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  23.46 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  21.5 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  21.5 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3525  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  24.26 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  18.98 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  21.85 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  22.92 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  22.07 
 
 
174 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
172 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  20 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
172 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  21 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  23.91 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
219 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  21.95 
 
 
174 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
200 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
144 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>