87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3588 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3588  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  312  8e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  26.23 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0524  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0172488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3369  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0203998  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1297  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  25.83 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  31.43 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  24.64 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  24.04 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  22.02 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  22.83 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  21.95 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  26.4 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  22.73 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 166 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 156 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 143 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 170 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  27.78 
 
 		 161 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 156 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  23.6 
 
 		 187 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  24.49 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  24.49 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  24.49 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  24.49 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  24.49 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4161  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000235966  normal  0.7718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  20.79 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  25.32 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 142 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 183 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>