25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3369 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3369  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 148 aa  306  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0203998  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1367  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000123372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3588  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1297  transcriptional regulator, MarR family  25.33 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  24.81 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  27.72 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 132 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  35.21 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  29.21 
 
 		 233 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  29.21 
 
 		 233 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 233 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>