More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6892 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  100 
 
 		 618 aa  1227    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  40.83 
 
 		 618 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  39.75 
 
 		 616 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  35.61 
 
 		 577 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  35.61 
 
 		 577 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  32.11 
 
 		 716 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  33.89 
 
 		 580 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  34.06 
 
 		 559 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  33.67 
 
 		 563 aa  187  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  32.8 
 
 		 566 aa  186  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  33.87 
 
 		 563 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  34.48 
 
 		 565 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  34.48 
 
 		 565 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  34.48 
 
 		 565 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  34.48 
 
 		 565 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  33.86 
 
 		 565 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  33.67 
 
 		 565 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  32.38 
 
 		 578 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  33.55 
 
 		 588 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  30.88 
 
 		 580 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 578 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  29.9 
 
 		 704 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  29.9 
 
 		 704 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  31.67 
 
 		 578 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  33.73 
 
 		 770 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  31.67 
 
 		 578 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  31.9 
 
 		 630 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  30.81 
 
 		 565 aa  178  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  36.64 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  32.22 
 
 		 733 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  31.51 
 
 		 578 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  30.53 
 
 		 575 aa  173  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  32.67 
 
 		 557 aa  171  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  33.64 
 
 		 421 aa  170  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  33.1 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  35.08 
 
 		 417 aa  169  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  30.36 
 
 		 732 aa  167  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  34.79 
 
 		 420 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  33.07 
 
 		 563 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  33.54 
 
 		 442 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  30.89 
 
 		 559 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  31.76 
 
 		 507 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  31.76 
 
 		 559 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  36.82 
 
 		 399 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  33.82 
 
 		 428 aa  160  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  33.82 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  33.82 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  33.82 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  31.67 
 
 		 566 aa  156  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  29.19 
 
 		 710 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  32.26 
 
 		 566 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  31.69 
 
 		 394 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  32.22 
 
 		 559 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  34.46 
 
 		 397 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  34.46 
 
 		 397 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  34.46 
 
 		 397 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  34.46 
 
 		 397 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  28.08 
 
 		 734 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  28.24 
 
 		 797 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  31.05 
 
 		 526 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  29.39 
 
 		 609 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 624 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  30.71 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 609 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  29.5 
 
 		 527 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  38.65 
 
 		 222 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  30.28 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  23.12 
 
 		 298 aa  95.9  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  26.55 
 
 		 376 aa  94  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  29.1 
 
 		 292 aa  89.7  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  28.5 
 
 		 527 aa  85.5  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  26.46 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  28.5 
 
 		 495 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.28 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.28 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.28 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.28 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.28 
 
 		 299 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.07 
 
 		 301 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  28.02 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  29.09 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  27.43 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  25.34 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.49 
 
 		 299 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.72 
 
 		 299 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 306 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  27.27 
 
 		 495 aa  76.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  27.18 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.69 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  23.8 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  26.27 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  22.41 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  26.18 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  25.17 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  26.19 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>