More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6609 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  99.05 
 
 
419 aa  838    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
419 aa  845    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
419 aa  845    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  60.1 
 
 
422 aa  494  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.31 
 
 
409 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  62.78 
 
 
414 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  61.33 
 
 
424 aa  481  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  59.41 
 
 
424 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.9 
 
 
422 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3143  peptidase M20  59.16 
 
 
424 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.138788  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  55.93 
 
 
422 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.7 
 
 
423 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  58.91 
 
 
424 aa  441  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.92 
 
 
409 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.16 
 
 
407 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55 
 
 
423 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.57 
 
 
410 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  55.16 
 
 
409 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  53.62 
 
 
411 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  54.77 
 
 
411 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  53.38 
 
 
413 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  49.65 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  51.42 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  51.42 
 
 
424 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1106  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.14 
 
 
184 aa  190  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802488  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.44 
 
 
442 aa  170  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.17 
 
 
398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.04 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.78 
 
 
410 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.68 
 
 
399 aa  140  6e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.04 
 
 
399 aa  139  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.49 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.87 
 
 
435 aa  130  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.03 
 
 
423 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.03 
 
 
439 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.61 
 
 
387 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.55 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.84 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  29.69 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.96 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  32.92 
 
 
404 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  32.2 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  30.22 
 
 
416 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.41 
 
 
413 aa  109  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.54 
 
 
400 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  31.25 
 
 
420 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  30.15 
 
 
373 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  29.23 
 
 
432 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.24 
 
 
366 aa  107  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  29.7 
 
 
399 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  30.03 
 
 
412 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.51 
 
 
365 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.96 
 
 
388 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.14 
 
 
365 aa  104  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0688  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 
365 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.18 
 
 
427 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.18198 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  29.35 
 
 
393 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.17 
 
 
365 aa  103  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  24.12 
 
 
415 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  26.46 
 
 
432 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  23.04 
 
 
415 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  23.58 
 
 
415 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.68 
 
 
365 aa  100  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.765563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.76 
 
 
392 aa  99.8  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  24.54 
 
 
421 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.48 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  29.93 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.11 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  20.87 
 
 
415 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.72 
 
 
424 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  29.08 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.39 
 
 
389 aa  97.4  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  26.23 
 
 
402 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  29.76 
 
 
382 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.13 
 
 
400 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  25.63 
 
 
422 aa  96.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.58 
 
 
396 aa  96.7  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  29.02 
 
 
404 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.13 
 
 
400 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  26.73 
 
 
379 aa  96.3  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  29.32 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  26.75 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.07 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  27.78 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.77 
 
 
426 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  25.53 
 
 
407 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  30.37 
 
 
402 aa  95.5  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  27.71 
 
 
374 aa  94.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.72 
 
 
422 aa  94.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  31.21 
 
 
380 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  26.88 
 
 
396 aa  94.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  29.06 
 
 
387 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  27.51 
 
 
397 aa  94.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.87 
 
 
395 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  28.79 
 
 
386 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  25.77 
 
 
384 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.43 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  26.88 
 
 
411 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.07 
 
 
385 aa  93.6  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3374  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.17 
 
 
424 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>