287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1457 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  100 
 
 
940 aa  1861    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.56 
 
 
757 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.02 
 
 
905 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.51 
 
 
575 aa  114  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.86 
 
 
799 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.54 
 
 
800 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.82 
 
 
614 aa  111  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.58 
 
 
901 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  24.09 
 
 
734 aa  108  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.28 
 
 
884 aa  107  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 
724 aa  107  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.48 
 
 
923 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.81 
 
 
614 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 
603 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  32.44 
 
 
889 aa  103  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  29.7 
 
 
980 aa  98.6  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.05 
 
 
609 aa  95.5  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  30.67 
 
 
627 aa  94.7  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  23.61 
 
 
739 aa  94.4  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.31 
 
 
1064 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  28.61 
 
 
590 aa  92.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.99 
 
 
720 aa  92  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.34 
 
 
623 aa  91.3  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.18 
 
 
640 aa  91.3  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.21 
 
 
620 aa  90.9  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  26.48 
 
 
597 aa  90.1  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.35 
 
 
614 aa  89.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.358579 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  27.43 
 
 
613 aa  89.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.84 
 
 
864 aa  89.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 
645 aa  89  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  23.41 
 
 
607 aa  89  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  27.07 
 
 
599 aa  88.6  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  28.09 
 
 
598 aa  88.2  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.45 
 
 
619 aa  86.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  26.71 
 
 
600 aa  85.9  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  26.24 
 
 
558 aa  85.5  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  23.99 
 
 
743 aa  84.3  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  27.96 
 
 
766 aa  83.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.29 
 
 
602 aa  82.4  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.4 
 
 
614 aa  80.5  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  28.57 
 
 
1015 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.84 
 
 
640 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25 
 
 
929 aa  80.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  24.37 
 
 
623 aa  78.6  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  23.93 
 
 
862 aa  77.8  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.99 
 
 
621 aa  77.8  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  21.53 
 
 
1045 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 
598 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.98 
 
 
587 aa  75.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.39 
 
 
744 aa  75.5  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  29.53 
 
 
603 aa  75.1  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.03 
 
 
1041 aa  75.1  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.02 
 
 
781 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  28.43 
 
 
584 aa  74.7  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  22.31 
 
 
951 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  23.72 
 
 
824 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 
888 aa  73.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  23.28 
 
 
785 aa  73.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  28.98 
 
 
928 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  26.53 
 
 
1084 aa  73.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.89 
 
 
710 aa  72.4  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  23.01 
 
 
626 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.7 
 
 
986 aa  72.4  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0991  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 
914 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.957169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 
781 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.45 
 
 
858 aa  72.4  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  22.77 
 
 
1046 aa  72  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  29.11 
 
 
832 aa  71.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.61 
 
 
644 aa  71.2  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  24.75 
 
 
563 aa  71.2  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  35.12 
 
 
894 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  20.97 
 
 
590 aa  70.5  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.58 
 
 
892 aa  70.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.96 
 
 
1036 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 
945 aa  70.1  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  26.12 
 
 
1084 aa  70.1  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 
916 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  26.36 
 
 
512 aa  69.7  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  24.57 
 
 
577 aa  69.3  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.53 
 
 
932 aa  69.3  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  26.34 
 
 
1024 aa  68.9  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.32 
 
 
1264 aa  68.6  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  23.22 
 
 
803 aa  68.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  24.91 
 
 
604 aa  68.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 
829 aa  67.8  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  23.56 
 
 
596 aa  67.8  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  28.36 
 
 
1028 aa  67.8  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  24 
 
 
564 aa  67  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.54 
 
 
882 aa  67.4  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.56 
 
 
595 aa  67  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.95 
 
 
805 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  23.8 
 
 
750 aa  67  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.35 
 
 
811 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  25.77 
 
 
1032 aa  66.6  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  22.89 
 
 
763 aa  66.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  25.88 
 
 
1029 aa  67  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.52 
 
 
1033 aa  66.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  22.19 
 
 
984 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  23.64 
 
 
707 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.53 
 
 
835 aa  65.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>