More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6722 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 364 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  55.46 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  49.71 
 
 		 374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 		 358 aa  299  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  50.47 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  43.16 
 
 		 391 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 371 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 453 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  34.33 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  30.38 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  30.74 
 
 		 332 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.38 
 
 		 676 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  47.5 
 
 		 1008 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2313  Fis family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 510 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  31.19 
 
 		 1399 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  44.88 
 
 		 971 aa  112  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.41 
 
 		 1407 aa  109  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 815 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 		 769 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1989  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  42.86 
 
 		 1110 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175442  normal  0.013335 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 488 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 871 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.15 
 
 		 1418 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  42.28 
 
 		 650 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  42.11 
 
 		 649 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 439 aa  96.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 382 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 1714 aa  95.9  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 839 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 834 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 526 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 603 aa  94.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 532 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 354 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 3706 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1560 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 874 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.02 
 
 		 895 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 2693 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 875 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.86 
 
 		 1668 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 681 aa  91.3  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 909 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.57 
 
 		 1303 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 732 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 941 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 1093 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 864 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 613 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.03 
 
 		 1239 aa  87.8  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 746 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 872 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 1654 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 348 aa  87  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 721 aa  86.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 832 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 1676 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 381 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 348 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 215 aa  86.3  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 991 aa  85.9  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 462 aa  85.9  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.86 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 878 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.19 
 
 		 783 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 932 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 913 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.23 
 
 		 1663 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.29 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 547 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.26 
 
 		 744 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 771 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 709 aa  84  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 964 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 674 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 1253 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  31.73 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>