102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6281 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  309  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  55.17 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  50.68 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.68 
 
 		 152 aa  156  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  49.32 
 
 		 152 aa  154  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  50.35 
 
 		 152 aa  146  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  41.25 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  42.03 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.28 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.97 
 
 		 204 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.12 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.53 
 
 		 192 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  32.38 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.52 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  32.56 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  35.53 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.11 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.14 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  30.51 
 
 		 171 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 184 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.79 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  28.68 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  32.93 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  30.68 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  32.89 
 
 		 178 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  38.16 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  28.19 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.97 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  28.43 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 205 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2140  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 		 288 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  38.33 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  29.46 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 344 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  30.56 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  32 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.08 
 
 		 294 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  28.41 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.47 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 305 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  33.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  33.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  33.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  33.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  33.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  31.03 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  33.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  33.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  33.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 160 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  34 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  27.55 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.31 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1393  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 303 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.74 
 
 		 421 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  28 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2071  hypothetical protein  32.88 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3672  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  25.4 
 
 		 210 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2023  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1467  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 296 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.145729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1451  transcriptional regulator, AraC family protein  36.54 
 
 		 296 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0743909  normal  0.362871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1817  transcriptional regulator, AraC family protein  36.54 
 
 		 296 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1486  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.012343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  32.35 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.26 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 199 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  30 
 
 		 389 aa  40  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  30.26 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  30.26 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 191 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 112 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>