82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2071 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2071  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3672  cupin 2 domain-containing protein  98.44 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2023  cupin 2 domain-containing protein  85.71 
 
 		 128 aa  226  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1138  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.52 
 
 		 120 aa  179  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4314  cupin 2 domain-containing protein  63.33 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.671076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2748  hypothetical protein  59.83 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32440  hypothetical protein  58.62 
 
 		 124 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279284  normal  0.628291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.68 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1263  cupin 2 domain-containing protein  59.17 
 
 		 124 aa  158  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  55.17 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3776  cupin 2 domain-containing protein  59.65 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4738  putative mannose-6-phosphate isomerase  56.56 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0188561  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5709  cupin region  54.92 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1451  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.22 
 
 		 124 aa  133  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  49.11 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0773  cupin 2 protein  48.04 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2572  cupin 2 domain-containing protein  42.48 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.37 
 
 		 119 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2052  cyclic nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0843968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4683  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.39 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.43245e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6454  cyclic nucleotide-binding protein  44.83 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.0803587 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2975  hypothetical protein  46.84 
 
 		 83 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000359936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3085  hypothetical protein  46.84 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000829377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3327  hypothetical protein  46.84 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3029  hypothetical protein  46.84 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1985  cupin domain protein  46.84 
 
 		 83 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2465  hypothetical protein  38.14 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0296269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  41.12 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4778  hypothetical protein  37.72 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156379  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3531  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.72 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0222774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3332  cyclic nucleotide-binding protein  42.86 
 
 		 130 aa  91.3  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.82 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1740  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.778095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.81 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3297  cupin domain protein  48 
 
 		 79 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3305  cupin domain protein  48 
 
 		 79 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2876  cupin 2 domain-containing protein  42.06 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1424  cupin 2 domain-containing protein  39.42 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.000000123197 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0026  double-stranded beta-helix-like protein  33.62 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0215  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.45 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.38 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6339  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2817  cupin 2 domain-containing protein  45.13 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0189675  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6039  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728658 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2296  cupin domain-containing protein  41.05 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2435  cupin domain-containing protein  41.05 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1711  hypothetical protein  41.05 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0760  cupin domain-containing protein  41.05 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558257  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03745  hypothetical protein  36.7 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0688  hypothetical protein  38.1 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00812076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2748  hypothetical protein  36.47 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.42 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.824016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 641 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4869  hypothetical protein  37.21 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4516  hypothetical protein  37.21 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4355  hypothetical protein  36.05 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.833469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4449  cupin 2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000519881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4739  YdbB  36.05 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0439  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4755  hypothetical protein  37.21 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4729  hypothetical protein  37.21 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4750  YdbB  36.05 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000160799  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0425  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.17 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0839073  hitchhiker  0.0000787974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0506  hypothetical protein  36.05 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4363  hypothetical protein  36.05 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0049775  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0036  hypothetical protein  38.1 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.059536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2567  hypothetical protein  33.33 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2050  DSBH domain-containing protein  30.68 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.82 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2546  cupin 2 domain-containing protein  27.55 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2431  hypothetical protein  27.27 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2391  cupin 2, barrel  43.55 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3365  hypothetical protein  39.39 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2346  cupin 2 domain-containing protein  23.71 
 
 		 100 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.36 
 
 		 294 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2901  cupin domain-containing protein  52.78 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  32.88 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  34.21 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  28.26 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1177  cyclic nucleotide-binding protein  23.96 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  35.09 
 
 		 171 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>