51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpl0036 on replicon NC_006366
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006366  plpl0036  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.059536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4683  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.33 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.43245e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.69 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4778  hypothetical protein  52.73 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156379  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1740  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.44 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.778095  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.88 
 
 
120 aa  70.1  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1451  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.44 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28609  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2296  cupin domain-containing protein  56.25 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2435  cupin domain-containing protein  56.25 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1711  hypothetical protein  56.25 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0760  cupin domain-containing protein  56.25 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558257  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.83 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0688  hypothetical protein  54.17 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00812076  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3531  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.72 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0222774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2465  hypothetical protein  46.03 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0296269  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2572  cupin 2 domain-containing protein  45.61 
 
 
121 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149975  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6039  cupin 2 domain-containing protein  55.32 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728658 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6339  cupin 2 domain-containing protein  55.32 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0773  cupin 2 protein  41.94 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707426  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2052  cyclic nucleotide-binding protein  42.59 
 
 
134 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0843968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3332  cyclic nucleotide-binding protein  38.98 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.31 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220888  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2748  hypothetical protein  39.68 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1138  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.68 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4314  cupin 2 domain-containing protein  48.08 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.671076  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3776  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849059  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32440  hypothetical protein  38.1 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279284  normal  0.628291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5709  cupin region  51.11 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0215  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.38 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0026  double-stranded beta-helix-like protein  42.31 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2071  hypothetical protein  38.1 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  43.4 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4738  putative mannose-6-phosphate isomerase  44.23 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0188561  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2876  cupin 2 domain-containing protein  40.74 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3672  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2023  cupin 2 domain-containing protein  44.9 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.51 
 
 
129 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1263  cupin 2 domain-containing protein  37.7 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56762  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.18 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6454  cyclic nucleotide-binding protein  36.07 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.0803587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 
641 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03745  hypothetical protein  40.38 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1424  cupin 2 domain-containing protein  38.78 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.000000123197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1985  cupin domain protein  38.78 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2975  hypothetical protein  38.78 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000359936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3029  hypothetical protein  38.78 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3327  hypothetical protein  38.78 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3085  hypothetical protein  38.78 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000829377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2817  cupin 2 domain-containing protein  48.08 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0189675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>