95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2052 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2052  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 134 aa  269  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0843968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  71.43 
 
 		 131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2876  cupin 2 domain-containing protein  67.67 
 
 		 131 aa  191  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3332  cyclic nucleotide-binding protein  66.41 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6454  cyclic nucleotide-binding protein  59.85 
 
 		 133 aa  164  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.0803587 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  53.21 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.17 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  38.6 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0773  cupin 2 protein  46.79 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0026  double-stranded beta-helix-like protein  38.26 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.22 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2748  hypothetical protein  42.74 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4314  cupin 2 domain-containing protein  42.34 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.671076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2023  cupin 2 domain-containing protein  42.2 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2071  hypothetical protein  43.12 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3672  cupin 2 domain-containing protein  43.12 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32440  hypothetical protein  41.03 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279284  normal  0.628291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2572  cupin 2 domain-containing protein  42.98 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6339  cupin 2 domain-containing protein  44.72 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1451  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.68 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4738  putative mannose-6-phosphate isomerase  43.12 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0188561  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5709  cupin region  40.54 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6039  cupin 2 domain-containing protein  44.26 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1138  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1263  cupin 2 domain-containing protein  38.26 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4683  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.09 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.43245e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.52 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3776  cupin 2 domain-containing protein  40.16 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4778  hypothetical protein  38.53 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156379  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2465  hypothetical protein  35.09 
 
 		 121 aa  90.5  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0296269  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0688  hypothetical protein  39.17 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00812076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3365  hypothetical protein  61.73 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0760  cupin domain-containing protein  38.33 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558257  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2296  cupin domain-containing protein  38.33 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1711  hypothetical protein  38.33 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2435  cupin domain-containing protein  38.33 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.34 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0215  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.44 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3531  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.47 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0222774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1740  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.778095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03745  hypothetical protein  32.74 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1424  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.000000123197 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2975  hypothetical protein  31.82 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000359936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3327  hypothetical protein  32.94 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3085  hypothetical protein  32.94 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000829377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3029  hypothetical protein  32.94 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1985  cupin domain protein  34.12 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3297  cupin domain protein  34.57 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3305  cupin domain protein  34.57 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 641 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0036  hypothetical protein  42.59 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.059536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2817  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0189675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2748  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5987  cupin domain-containing protein  33.98 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0536952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2688  cupin 2 domain-containing protein  33.01 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2048  cupin 2, barrel  33.01 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2659  cupin 2 domain-containing protein  33.01 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.47 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.824016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5970  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.374591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2706  cupin 2 domain-containing protein  35.79 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4869  hypothetical protein  34.94 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0638  cupin 2 domain-containing protein  34.74 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4739  YdbB  34.94 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4355  hypothetical protein  34.94 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.833469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4363  hypothetical protein  31.33 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0049775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4449  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000519881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1663  hypothetical protein  31.58 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.231428  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4755  hypothetical protein  31.33 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1177  cyclic nucleotide-binding protein  32.63 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4516  hypothetical protein  34.94 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4750  YdbB  31.33 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000160799  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0422  hypothetical protein  41.43 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2206  hypothetical protein  41.43 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.747866 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1800  hypothetical protein  41.43 
 
 		 103 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4729  hypothetical protein  30.12 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1238  cyclic nucleotide-binding protein  32.63 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.103405  normal  0.772826 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0471  cupin domain-containing protein  41.43 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2374  cupin domain-containing protein  41.43 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2513  cupin domain-containing protein  41.43 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0506  hypothetical protein  32.53 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4719  cupin domain-containing protein  32.63 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.0255317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4056  cupin 2, barrel  32.22 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.27583  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0826  DSBH domain-containing protein  41.43 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.432318  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0481  hypothetical protein  33.68 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16440  hypothetical protein  34.74 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0425  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0839073  hitchhiker  0.0000787974 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2346  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0439  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0656  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0633  hypothetical protein  38.57 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.641228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0683  3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase  33.33 
 
 		 176 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.800919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2391  cupin 2, barrel  28.44 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0664  cupin 2 domain-containing protein  37.88 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>