39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5970 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5970  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
103 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.374591  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2206  hypothetical protein  93.2 
 
 
121 aa  203  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.747866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4719  cupin domain-containing protein  86.41 
 
 
103 aa  188  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.0255317 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0826  DSBH domain-containing protein  83.5 
 
 
203 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.432318  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0422  hypothetical protein  83.5 
 
 
105 aa  185  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0471  cupin domain-containing protein  83.5 
 
 
120 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2374  cupin domain-containing protein  83.5 
 
 
120 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2513  cupin domain-containing protein  83.5 
 
 
120 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1800  hypothetical protein  83.5 
 
 
103 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0638  cupin 2 domain-containing protein  81.55 
 
 
103 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0633  hypothetical protein  80.58 
 
 
120 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.641228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2688  cupin 2 domain-containing protein  80.58 
 
 
103 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2048  cupin 2, barrel  80.58 
 
 
103 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2659  cupin 2 domain-containing protein  80.58 
 
 
103 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1663  hypothetical protein  80.58 
 
 
103 aa  177  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.231428  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2706  cupin 2 domain-containing protein  77.67 
 
 
103 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2580  cupin 2 domain-containing protein  77.67 
 
 
103 aa  176  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5987  cupin domain-containing protein  79.61 
 
 
103 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0536952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4056  cupin 2, barrel  78.43 
 
 
103 aa  174  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.27583  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1238  cyclic nucleotide-binding protein  77.67 
 
 
103 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.103405  normal  0.772826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0656  cupin 2 domain-containing protein  72.82 
 
 
103 aa  166  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1177  cyclic nucleotide-binding protein  75.73 
 
 
103 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0481  hypothetical protein  74.76 
 
 
119 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2050  DSBH domain-containing protein  66.02 
 
 
103 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2431  hypothetical protein  58.25 
 
 
103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1160  cupin 2, barrel  61.54 
 
 
104 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677962  decreased coverage  0.00806774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1271  cupin 2 domain-containing protein  60.2 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.113842  hitchhiker  0.00655091 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16440  hypothetical protein  56.31 
 
 
103 aa  123  9e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0253  hypothetical protein  63.49 
 
 
83 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2052  cyclic nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0843968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  41.54 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6454  cyclic nucleotide-binding protein  30.63 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.0803587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2876  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2748  hypothetical protein  29.91 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32440  hypothetical protein  32 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279284  normal  0.628291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4314  cupin 2 domain-containing protein  27.47 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.671076  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  25.81 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1263  cupin 2 domain-containing protein  28.41 
 
 
124 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56762  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  25.27 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.753369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>