38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2706 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2706  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2580  cupin 2 domain-containing protein  98.06 
 
 		 103 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2688  cupin 2 domain-containing protein  91.26 
 
 		 103 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5987  cupin domain-containing protein  92.23 
 
 		 103 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0536952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2048  cupin 2, barrel  91.26 
 
 		 103 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2659  cupin 2 domain-containing protein  91.26 
 
 		 103 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4748  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4719  cupin domain-containing protein  83.5 
 
 		 103 aa  189  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.0255317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0638  cupin 2 domain-containing protein  85.44 
 
 		 103 aa  185  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2206  hypothetical protein  78.64 
 
 		 121 aa  177  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.747866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5970  Cupin 2 conserved barrel domain protein  77.67 
 
 		 103 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.374591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0826  DSBH domain-containing protein  75.73 
 
 		 203 aa  175  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.432318  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0633  hypothetical protein  76.7 
 
 		 120 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.641228  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0422  hypothetical protein  75.73 
 
 		 105 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0471  cupin domain-containing protein  75.73 
 
 		 120 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2374  cupin domain-containing protein  75.73 
 
 		 120 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2513  cupin domain-containing protein  75.73 
 
 		 120 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1800  hypothetical protein  75.73 
 
 		 103 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1663  hypothetical protein  75.73 
 
 		 103 aa  167  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.231428  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1177  cyclic nucleotide-binding protein  74.76 
 
 		 103 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1238  cyclic nucleotide-binding protein  73.79 
 
 		 103 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.103405  normal  0.772826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0656  cupin 2 domain-containing protein  69.9 
 
 		 103 aa  161  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4056  cupin 2, barrel  69.61 
 
 		 103 aa  159  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.27583  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0481  hypothetical protein  69.9 
 
 		 119 aa  156  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2050  DSBH domain-containing protein  65.05 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2431  hypothetical protein  53.4 
 
 		 103 aa  123  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16440  hypothetical protein  54.37 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1271  cupin 2 domain-containing protein  59.18 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.113842  hitchhiker  0.00655091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1160  cupin 2, barrel  57.69 
 
 		 104 aa  120  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677962  decreased coverage  0.00806774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0253  hypothetical protein  66.07 
 
 		 83 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2052  cyclic nucleotide-binding protein  35.79 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0843968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  34.83 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6454  cyclic nucleotide-binding protein  37.65 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.0803587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2876  cupin 2 domain-containing protein  32.58 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2748  hypothetical protein  27.45 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32440  hypothetical protein  28.43 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279284  normal  0.628291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4314  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.671076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>