55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2431 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2431  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  214  4e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1663  hypothetical protein  61.17 
 
 
103 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.231428  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1177  cyclic nucleotide-binding protein  59.22 
 
 
103 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0481  hypothetical protein  58.25 
 
 
119 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1238  cyclic nucleotide-binding protein  58.25 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.103405  normal  0.772826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2659  cupin 2 domain-containing protein  57.28 
 
 
103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2048  cupin 2, barrel  57.28 
 
 
103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0638  cupin 2 domain-containing protein  57.28 
 
 
103 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4719  cupin domain-containing protein  57.28 
 
 
103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.0255317 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5970  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.25 
 
 
103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.374591  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5987  cupin domain-containing protein  56.31 
 
 
103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0536952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2688  cupin 2 domain-containing protein  56.31 
 
 
103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2206  hypothetical protein  57.28 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.747866 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16440  hypothetical protein  54.37 
 
 
103 aa  123  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2706  cupin 2 domain-containing protein  53.4 
 
 
103 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0633  hypothetical protein  54.37 
 
 
120 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.641228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2580  cupin 2 domain-containing protein  53.4 
 
 
103 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0656  cupin 2 domain-containing protein  59.22 
 
 
103 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0826  DSBH domain-containing protein  54.37 
 
 
203 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.432318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2513  cupin domain-containing protein  54.37 
 
 
120 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2374  cupin domain-containing protein  54.37 
 
 
120 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0471  cupin domain-containing protein  54.37 
 
 
120 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0422  hypothetical protein  54.37 
 
 
105 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1800  hypothetical protein  54.37 
 
 
103 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1160  cupin 2, barrel  54.81 
 
 
104 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677962  decreased coverage  0.00806774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2050  DSBH domain-containing protein  50.49 
 
 
103 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4056  cupin 2, barrel  51.02 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.27583  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1271  cupin 2 domain-containing protein  49.02 
 
 
103 aa  107  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.113842  hitchhiker  0.00655091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0253  hypothetical protein  58 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32440  hypothetical protein  33.67 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279284  normal  0.628291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2748  hypothetical protein  32.65 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1138  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1451  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28609  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  28 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  29 
 
 
121 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1263  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56762  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1985  cupin domain protein  28.75 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3332  cyclic nucleotide-binding protein  28.71 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3085  hypothetical protein  27.5 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000829377  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4314  cupin 2 domain-containing protein  29 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.671076  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3327  hypothetical protein  27.5 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2975  hypothetical protein  27.5 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000359936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3029  hypothetical protein  27.5 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3776  cupin 2 domain-containing protein  29.55 
 
 
135 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849059  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.73 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3297  cupin domain protein  27.27 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3305  cupin domain protein  27.27 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5709  cupin region  26.6 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4738  putative mannose-6-phosphate isomerase  26.6 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0188561  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3672  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2071  hypothetical protein  27.27 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2023  cupin 2 domain-containing protein  27 
 
 
128 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03745  hypothetical protein  25.49 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>