82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3776 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3776  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
135 aa  274  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849059  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2071  hypothetical protein  54.55 
 
 
128 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3672  cupin 2 domain-containing protein  54.55 
 
 
128 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2023  cupin 2 domain-containing protein  56.2 
 
 
128 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32440  hypothetical protein  60 
 
 
124 aa  146  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279284  normal  0.628291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2748  hypothetical protein  59.83 
 
 
122 aa  146  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4314  cupin 2 domain-containing protein  59.13 
 
 
128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.671076  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.76 
 
 
129 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1138  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.03 
 
 
120 aa  144  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5709  cupin region  54.35 
 
 
141 aa  143  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1263  cupin 2 domain-containing protein  58.26 
 
 
124 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56762  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4738  putative mannose-6-phosphate isomerase  52.17 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0188561  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  49.12 
 
 
121 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1451  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.26 
 
 
124 aa  130  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28609  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  43.22 
 
 
133 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.14 
 
 
119 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4683  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 
124 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.43245e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0773  cupin 2 protein  40.95 
 
 
116 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707426  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2465  hypothetical protein  42.99 
 
 
121 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0296269  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6339  cupin 2 domain-containing protein  45.71 
 
 
132 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6039  cupin 2 domain-containing protein  45.71 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2572  cupin 2 domain-containing protein  44.23 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149975  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.11 
 
 
121 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4778  hypothetical protein  35.59 
 
 
124 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156379  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2052  cyclic nucleotide-binding protein  40.16 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0843968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3531  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.2 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0222774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1740  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.18 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.778095  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  40.68 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0215  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.45 
 
 
127 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.28 
 
 
125 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3332  cyclic nucleotide-binding protein  40.95 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.81 
 
 
120 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6454  cyclic nucleotide-binding protein  38.66 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.0803587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.53 
 
 
127 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220888  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0026  double-stranded beta-helix-like protein  30.77 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0688  hypothetical protein  44.21 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00812076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3085  hypothetical protein  45.57 
 
 
83 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000829377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3327  hypothetical protein  45.57 
 
 
83 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2975  hypothetical protein  45.57 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000359936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3029  hypothetical protein  45.57 
 
 
83 aa  84.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2876  cupin 2 domain-containing protein  39.64 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1424  cupin 2 domain-containing protein  40.57 
 
 
123 aa  84  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.000000123197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1985  cupin domain protein  45.57 
 
 
83 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3297  cupin domain protein  46.67 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3305  cupin domain protein  46.67 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2296  cupin domain-containing protein  41.67 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2435  cupin domain-containing protein  41.05 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1711  hypothetical protein  41.05 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0760  cupin domain-containing protein  41.05 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2817  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0189675  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03745  hypothetical protein  32.08 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
641 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4363  hypothetical protein  40.58 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0049775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4449  cupin 2 domain-containing protein  40.58 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000519881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4755  hypothetical protein  40.58 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4869  hypothetical protein  38.24 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4750  YdbB  40.58 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000160799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4729  hypothetical protein  40.58 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4739  YdbB  38.24 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0036  hypothetical protein  37.5 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.059536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4355  hypothetical protein  38.24 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.833469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4516  hypothetical protein  38.24 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0506  hypothetical protein  39.13 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2748  hypothetical protein  32.1 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2567  hypothetical protein  37.29 
 
 
64 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.824016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0425  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.1 
 
 
110 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0839073  hitchhiker  0.0000787974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0439  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395009  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2431  hypothetical protein  29.55 
 
 
103 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3365  hypothetical protein  43.55 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1800  hypothetical protein  30.68 
 
 
103 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0471  cupin domain-containing protein  30.68 
 
 
120 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2513  cupin domain-containing protein  30.68 
 
 
120 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2374  cupin domain-containing protein  30.68 
 
 
120 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0422  hypothetical protein  30.68 
 
 
105 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0826  DSBH domain-containing protein  30.68 
 
 
203 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.432318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0656  cupin 2 domain-containing protein  29.55 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2050  DSBH domain-containing protein  31.82 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4056  cupin 2, barrel  30.59 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.27583  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1663  hypothetical protein  29.67 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.231428  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0633  hypothetical protein  30.68 
 
 
120 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.641228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>