72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4778 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4778  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  254  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156379  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4683  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.16 
 
 		 124 aa  158  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.43245e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1740  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.81 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.778095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0026  double-stranded beta-helix-like protein  44.72 
 
 		 123 aa  132  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.19 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.76 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3531  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.76 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0222774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.34 
 
 		 119 aa  120  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2572  cupin 2 domain-containing protein  42.5 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  43.36 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2465  hypothetical protein  45.38 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0296269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1138  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.5 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1711  hypothetical protein  46.73 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0760  cupin domain-containing protein  46.73 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558257  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2296  cupin domain-containing protein  46.3 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2435  cupin domain-containing protein  46.73 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.79 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4314  cupin 2 domain-containing protein  41.38 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.671076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2817  cupin 2 domain-containing protein  48.8 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0189675  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0688  hypothetical protein  44.86 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00812076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32440  hypothetical protein  40.68 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279284  normal  0.628291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0215  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.02 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1263  cupin 2 domain-containing protein  39.66 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1451  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.59 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2023  cupin 2 domain-containing protein  40.52 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2748  hypothetical protein  39.83 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4738  putative mannose-6-phosphate isomerase  36.89 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0188561  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5709  cupin region  36.07 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0773  cupin 2 protein  40 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.34 
 
 		 127 aa  97.1  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03745  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6039  cupin 2 domain-containing protein  41.96 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728658 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6339  cupin 2 domain-containing protein  43.52 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3672  cupin 2 domain-containing protein  37.39 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3776  cupin 2 domain-containing protein  35.34 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2052  cyclic nucleotide-binding protein  38.53 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0843968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2071  hypothetical protein  37.72 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  35.96 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1424  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.000000123197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6454  cyclic nucleotide-binding protein  37.96 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.0803587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  35.78 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3332  cyclic nucleotide-binding protein  37.04 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.36 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2876  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1985  cupin domain protein  37.93 
 
 		 83 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3029  hypothetical protein  37.93 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3327  hypothetical protein  37.93 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2975  hypothetical protein  37.93 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000359936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3085  hypothetical protein  37.93 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000829377  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0036  hypothetical protein  52.73 
 
 		 72 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.059536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 641 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3297  cupin domain protein  37.35 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3305  cupin domain protein  37.35 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4355  hypothetical protein  28.42 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.833469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4750  YdbB  28.42 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000160799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4739  YdbB  28.42 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0506  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4516  hypothetical protein  29.47 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4449  cupin 2 domain-containing protein  32.1 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000519881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4869  hypothetical protein  29.47 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4729  hypothetical protein  32 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4363  hypothetical protein  34.43 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0049775  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  38.3 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2748  hypothetical protein  28.77 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1271  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 103 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.113842  hitchhiker  0.00655091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3098  cupin 2 protein  44.74 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.798535  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  28.05 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5987  cupin domain-containing protein  25.88 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0536952 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.824016 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2391  cupin 2, barrel  23.81 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1160  cupin 2, barrel  27.94 
 
 		 104 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677962  decreased coverage  0.00806774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>