36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1271 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1271  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
103 aa  210  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.113842  hitchhiker  0.00655091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2206  hypothetical protein  60.78 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.747866 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0481  hypothetical protein  59.8 
 
 
119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0638  cupin 2 domain-containing protein  63.27 
 
 
103 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1238  cyclic nucleotide-binding protein  61.76 
 
 
103 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.103405  normal  0.772826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5970  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.2 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.374591  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1177  cyclic nucleotide-binding protein  60.78 
 
 
103 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4719  cupin domain-containing protein  60.61 
 
 
103 aa  123  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.0255317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4056  cupin 2, barrel  56.31 
 
 
103 aa  123  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.27583  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0656  cupin 2 domain-containing protein  58.16 
 
 
103 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5987  cupin domain-containing protein  61.22 
 
 
103 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0536952 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0422  hypothetical protein  60.2 
 
 
105 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1800  hypothetical protein  60.2 
 
 
103 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2659  cupin 2 domain-containing protein  61.22 
 
 
103 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2048  cupin 2, barrel  61.22 
 
 
103 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0826  DSBH domain-containing protein  60.2 
 
 
203 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.432318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2513  cupin domain-containing protein  60.2 
 
 
120 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2374  cupin domain-containing protein  60.2 
 
 
120 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0471  cupin domain-containing protein  60.2 
 
 
120 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2688  cupin 2 domain-containing protein  61.22 
 
 
103 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1663  hypothetical protein  59.18 
 
 
103 aa  120  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.231428  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2706  cupin 2 domain-containing protein  59.18 
 
 
103 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0633  hypothetical protein  59.18 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.641228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2580  cupin 2 domain-containing protein  59.18 
 
 
103 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16440  hypothetical protein  54.9 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2050  DSBH domain-containing protein  50 
 
 
103 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2431  hypothetical protein  49.02 
 
 
103 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1160  cupin 2, barrel  51.52 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677962  decreased coverage  0.00806774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0253  hypothetical protein  47.46 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0026  double-stranded beta-helix-like protein  27.06 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  29.55 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  37.7 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  26.14 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4778  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156379  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5709  cupin region  34.38 
 
 
141 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2876  cupin 2 domain-containing protein  34.43 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  0.230975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>