90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0773 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0773  cupin 2 protein  100 
 
 
116 aa  238  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707426  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  73.87 
 
 
133 aa  176  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1138  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.88 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32440  hypothetical protein  53.33 
 
 
124 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279284  normal  0.628291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  46.67 
 
 
121 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.15 
 
 
129 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.69 
 
 
119 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2748  hypothetical protein  54.37 
 
 
122 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4314  cupin 2 domain-containing protein  49.52 
 
 
128 aa  120  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.671076  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5709  cupin region  50.42 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2572  cupin 2 domain-containing protein  45.69 
 
 
121 aa  118  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149975  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1451  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.85 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28609  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1263  cupin 2 domain-containing protein  47.22 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56762  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2023  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 
128 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4683  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.17 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.43245e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4738  putative mannose-6-phosphate isomerase  48.74 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0188561  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0026  double-stranded beta-helix-like protein  44.55 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3672  cupin 2 domain-containing protein  48.04 
 
 
128 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2071  hypothetical protein  48.04 
 
 
128 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  51.4 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2876  cupin 2 domain-containing protein  47.66 
 
 
131 aa  107  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2465  hypothetical protein  39.62 
 
 
121 aa  107  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0296269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2052  cyclic nucleotide-binding protein  46.79 
 
 
134 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0843968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3332  cyclic nucleotide-binding protein  49.52 
 
 
130 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0215  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.34 
 
 
127 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.15 
 
 
125 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.57 
 
 
121 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.24 
 
 
127 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220888  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6454  cyclic nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
133 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.0803587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.86 
 
 
120 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1740  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.86 
 
 
120 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.778095  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4778  hypothetical protein  40 
 
 
124 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156379  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3776  cupin 2 domain-containing protein  40.78 
 
 
135 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849059  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3531  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.37 
 
 
125 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0222774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1424  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.000000123197 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6339  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 
132 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6039  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 
132 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2975  hypothetical protein  44.3 
 
 
83 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000359936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1985  cupin domain protein  44.3 
 
 
83 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3085  hypothetical protein  44.3 
 
 
83 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000829377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3327  hypothetical protein  44.3 
 
 
83 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3029  hypothetical protein  44.3 
 
 
83 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03745  hypothetical protein  35.65 
 
 
121 aa  87  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3305  cupin domain protein  47.3 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3297  cupin domain protein  47.3 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2435  cupin domain-containing protein  39.29 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2296  cupin domain-containing protein  39.29 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1711  hypothetical protein  39.29 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0760  cupin domain-containing protein  39.29 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0688  hypothetical protein  39.29 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00812076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2817  cupin 2 domain-containing protein  39.66 
 
 
121 aa  84.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0189675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 
641 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4355  hypothetical protein  34.69 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.833469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4739  YdbB  36.36 
 
 
110 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4363  hypothetical protein  34.09 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0049775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4750  YdbB  35.23 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000160799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4729  hypothetical protein  34.09 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4755  hypothetical protein  34.09 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4869  hypothetical protein  34.09 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0506  hypothetical protein  32.95 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4516  hypothetical protein  32.65 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.85 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.824016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4449  cupin 2 domain-containing protein  32.95 
 
 
110 aa  58.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000519881  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0036  hypothetical protein  41.94 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.059536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3365  hypothetical protein  45.9 
 
 
114 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2748  hypothetical protein  29.58 
 
 
116 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  34.04 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2567  hypothetical protein  38.98 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0425  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.53 
 
 
110 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0839073  hitchhiker  0.0000787974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4402  3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase  31.53 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0439  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.55 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395009  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2346  cupin 2 domain-containing protein  25.53 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1238  cyclic nucleotide-binding protein  32.84 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.103405  normal  0.772826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1177  cyclic nucleotide-binding protein  32.84 
 
 
103 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1160  cupin 2, barrel  35.82 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677962  decreased coverage  0.00806774 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0481  hypothetical protein  34.33 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2151  3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase  39.29 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1800  hypothetical protein  29.85 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0422  hypothetical protein  29.85 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0471  cupin domain-containing protein  29.85 
 
 
120 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2374  cupin domain-containing protein  29.85 
 
 
120 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2513  cupin domain-containing protein  29.85 
 
 
120 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0826  DSBH domain-containing protein  29.85 
 
 
203 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.432318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>