More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4793 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 393 aa  783    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  59.76 
 
 		 439 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  55.68 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  58.5 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  54.59 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  54.67 
 
 		 428 aa  364  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  66.13 
 
 		 427 aa  352  8e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  43.97 
 
 		 269 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  42.68 
 
 		 270 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  41.59 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  41.84 
 
 		 322 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  43.3 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  41.3 
 
 		 265 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  43.46 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  39.83 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  40.17 
 
 		 308 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  41.15 
 
 		 311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  42.62 
 
 		 293 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 265 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 260 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  42.61 
 
 		 267 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  40.55 
 
 		 307 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  41.26 
 
 		 350 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 346 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  38.29 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  39.37 
 
 		 321 aa  159  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  38.16 
 
 		 345 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 281 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.51 
 
 		 251 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.92 
 
 		 321 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 503 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.69 
 
 		 241 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  35.45 
 
 		 291 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  31.47 
 
 		 373 aa  96.3  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.98 
 
 		 417 aa  95.5  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 217 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 273 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  36.27 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  36.27 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 260 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 285 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  35.23 
 
 		 275 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  34.18 
 
 		 244 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 305 aa  93.2  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 275 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 542 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 		 1002 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 890 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.85 
 
 		 468 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.67 
 
 		 241 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 1120 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 220 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 213 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 213 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 213 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 213 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 		 273 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 277 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 		 259 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 		 272 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 		 275 aa  90.5  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 		 267 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 275 aa  89.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 241 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  36.1 
 
 		 404 aa  89.7  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 		 284 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 		 287 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 241 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  34.76 
 
 		 242 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 204 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  32.47 
 
 		 903 aa  87  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 247 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.73 
 
 		 1115 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  30.73 
 
 		 1115 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.73 
 
 		 1119 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 900 aa  87  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 273 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 273 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 		 317 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 871 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 273 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 275 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  30.73 
 
 		 927 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 		 372 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 261 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>