More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3658 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.51 
 
 
741 aa  892    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 
722 aa  1490    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  45.53 
 
 
740 aa  687    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.94 
 
 
738 aa  415  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  33.97 
 
 
736 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.31 
 
 
725 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  33.56 
 
 
740 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  35.43 
 
 
723 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  35.12 
 
 
734 aa  392  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.29 
 
 
744 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.23 
 
 
711 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.19 
 
 
736 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  33.42 
 
 
743 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.79 
 
 
743 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.94 
 
 
783 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.74 
 
 
734 aa  368  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  32.24 
 
 
751 aa  359  9e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.87 
 
 
740 aa  359  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.75 
 
 
739 aa  353  8e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.88 
 
 
755 aa  340  4e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.12 
 
 
710 aa  336  9e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  32.97 
 
 
746 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33 
 
 
716 aa  323  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.01 
 
 
708 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.78 
 
 
696 aa  293  9e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.78 
 
 
706 aa  291  4e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.55 
 
 
696 aa  279  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.58 
 
 
711 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.96 
 
 
701 aa  275  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.03 
 
 
675 aa  269  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  31.73 
 
 
925 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  31.42 
 
 
925 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
716 aa  262  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  32.64 
 
 
694 aa  250  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.59 
 
 
694 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.47 
 
 
711 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.46 
 
 
698 aa  229  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  32.08 
 
 
702 aa  228  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  28.69 
 
 
710 aa  219  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  30.05 
 
 
753 aa  194  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.3 
 
 
931 aa  193  9e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.84 
 
 
890 aa  187  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  28.28 
 
 
955 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.05 
 
 
913 aa  183  8.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.43 
 
 
916 aa  183  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.4 
 
 
926 aa  182  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  25.25 
 
 
939 aa  180  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  27.34 
 
 
943 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.5 
 
 
905 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  29.03 
 
 
875 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.62 
 
 
970 aa  172  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.72 
 
 
933 aa  171  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.23 
 
 
916 aa  171  6e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.47 
 
 
912 aa  167  9e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  28.47 
 
 
1480 aa  166  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  28.22 
 
 
954 aa  166  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.84 
 
 
972 aa  165  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  26.43 
 
 
946 aa  164  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.63 
 
 
1534 aa  164  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  27.51 
 
 
873 aa  161  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.1 
 
 
946 aa  161  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.77 
 
 
932 aa  161  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  27.14 
 
 
1688 aa  160  6e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.14 
 
 
806 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.79 
 
 
928 aa  159  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.61 
 
 
909 aa  158  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.91 
 
 
1476 aa  158  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  26.63 
 
 
1549 aa  157  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.04 
 
 
915 aa  156  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.87 
 
 
913 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  28.12 
 
 
898 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.2 
 
 
927 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.58 
 
 
1514 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  26.48 
 
 
1523 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.48 
 
 
1523 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.04 
 
 
1523 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  27.92 
 
 
915 aa  153  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.45 
 
 
897 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  28.76 
 
 
1572 aa  153  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.4 
 
 
854 aa  151  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  26.46 
 
 
1495 aa  151  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  28.33 
 
 
1448 aa  151  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.41 
 
 
888 aa  150  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  28.39 
 
 
1431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  29.14 
 
 
1584 aa  149  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  29.25 
 
 
874 aa  148  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  28.19 
 
 
1573 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  29.25 
 
 
874 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.01 
 
 
1475 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.27 
 
 
903 aa  147  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  25.93 
 
 
834 aa  146  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  27.26 
 
 
1388 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.8 
 
 
874 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  29.72 
 
 
799 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  27.92 
 
 
1448 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  29.05 
 
 
903 aa  145  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.9 
 
 
928 aa  145  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  26.64 
 
 
1538 aa  144  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  27.27 
 
 
1535 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.04 
 
 
809 aa  144  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>