More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2908 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 727 aa  1440    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0828  lipopolysaccharide biosynthesis protein  69.25 
 
 		 726 aa  951    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.490846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  44.63 
 
 		 731 aa  590  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3592  chromosome partitioning ATPase  44.57 
 
 		 735 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.857292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2514  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.43 
 
 		 735 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.36 
 
 		 720 aa  187  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  28.45 
 
 		 727 aa  170  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.45 
 
 		 722 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.26 
 
 		 736 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.71 
 
 		 734 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.96 
 
 		 742 aa  144  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 751 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 751 aa  141  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  23.95 
 
 		 741 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 778 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  27.7 
 
 		 741 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  21.98 
 
 		 753 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.62 
 
 		 770 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 		 804 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 760 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  24.75 
 
 		 763 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  23.32 
 
 		 684 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  25.08 
 
 		 743 aa  115  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  22.55 
 
 		 795 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  24.35 
 
 		 739 aa  112  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.6 
 
 		 820 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  28.11 
 
 		 624 aa  108  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  29.93 
 
 		 464 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  26.27 
 
 		 784 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  22.92 
 
 		 772 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 738 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  31.72 
 
 		 496 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  23.71 
 
 		 753 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  23.36 
 
 		 750 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 730 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.4 
 
 		 755 aa  102  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  32.98 
 
 		 585 aa  100  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  22.8 
 
 		 741 aa  99.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0764  protein-tyrosine kinase  26.51 
 
 		 763 aa  99.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0280941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  31.47 
 
 		 246 aa  99.4  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  33.96 
 
 		 803 aa  99.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.08 
 
 		 779 aa  98.6  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  22.83 
 
 		 726 aa  99  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  24.18 
 
 		 775 aa  98.6  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.43 
 
 		 721 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  25.45 
 
 		 738 aa  97.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  23.57 
 
 		 801 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  32.08 
 
 		 803 aa  96.3  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 737 aa  95.5  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  26.33 
 
 		 815 aa  95.1  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 731 aa  94.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4516  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 		 740 aa  94.4  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265427  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  23.82 
 
 		 743 aa  94.7  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 		 795 aa  94.4  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  23.65 
 
 		 796 aa  93.2  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  22.41 
 
 		 759 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.02 
 
 		 778 aa  92.8  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0519  capsular exopolysaccharide family  31.68 
 
 		 819 aa  92.8  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.3 
 
 		 720 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  21.29 
 
 		 711 aa  91.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  24.26 
 
 		 800 aa  90.9  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  22.71 
 
 		 790 aa  90.9  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22230  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.12 
 
 		 217 aa  90.9  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 759 aa  90.9  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.44 
 
 		 217 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  29.44 
 
 		 217 aa  90.5  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.57 
 
 		 235 aa  89.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  33.68 
 
 		 605 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  28.94 
 
 		 778 aa  89.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  21.68 
 
 		 806 aa  89  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  32.99 
 
 		 205 aa  89  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.04 
 
 		 482 aa  88.6  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.6 
 
 		 722 aa  87.4  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  27.55 
 
 		 466 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.64 
 
 		 739 aa  86.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  28.21 
 
 		 783 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  32.12 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.8 
 
 		 741 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  25.06 
 
 		 815 aa  85.1  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  23.38 
 
 		 753 aa  85.5  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.96 
 
 		 735 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4163  lipopolysaccharide biosynthesis  27.96 
 
 		 748 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214287  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4203  lipopolysaccharide biosynthesis  27.96 
 
 		 748 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.81 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  30.3 
 
 		 766 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  29.69 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.24 
 
 		 575 aa  84.7  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.12 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  24.6 
 
 		 767 aa  84  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  21.91 
 
 		 756 aa  84  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13861  hypothetical protein  22.97 
 
 		 780 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.832923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  29.5 
 
 		 232 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  25.97 
 
 		 789 aa  84  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  30.73 
 
 		 233 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  30.21 
 
 		 233 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  27.27 
 
 		 443 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  29.85 
 
 		 492 aa  83.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  22.35 
 
 		 794 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  29.74 
 
 		 249 aa  84  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  25.34 
 
 		 741 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>