More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2189 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  52.19 
 
 		 1212 aa  1187    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  53.77 
 
 		 1170 aa  1193    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  58.79 
 
 		 1168 aa  1356    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  50.04 
 
 		 1169 aa  1122    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  49.89 
 
 		 906 aa  831    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  59.69 
 
 		 774 aa  872    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  74.24 
 
 		 1194 aa  1753    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 1172 aa  2391    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  50.4 
 
 		 760 aa  718    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  53.48 
 
 		 1167 aa  1183    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  53.95 
 
 		 1167 aa  1194    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  54.67 
 
 		 829 aa  819    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  50.3 
 
 		 1170 aa  1095    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  47.74 
 
 		 1136 aa  981    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  53.5 
 
 		 1160 aa  1185    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  53.36 
 
 		 1170 aa  1224    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  57.89 
 
 		 1160 aa  1325    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  52.07 
 
 		 1172 aa  1196    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  51.06 
 
 		 1169 aa  1122    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  48.03 
 
 		 1137 aa  1001    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  54.06 
 
 		 1170 aa  1199    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  53.74 
 
 		 1167 aa  1196    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  43.57 
 
 		 964 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  51.3 
 
 		 814 aa  568  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  58.73 
 
 		 440 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  35.73 
 
 		 1129 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  33.1 
 
 		 1138 aa  458  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  38.49 
 
 		 1116 aa  446  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  32.23 
 
 		 1145 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  77.46 
 
 		 283 aa  438  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1144 aa  430  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  57.14 
 
 		 1131 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  33.55 
 
 		 1147 aa  399  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  39.5 
 
 		 565 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  34.43 
 
 		 835 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  33.54 
 
 		 1062 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.35 
 
 		 988 aa  317  6e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  33.1 
 
 		 969 aa  278  5e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  31.12 
 
 		 971 aa  271  7e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  31.66 
 
 		 969 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  32.96 
 
 		 966 aa  267  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  32.7 
 
 		 962 aa  266  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  32.47 
 
 		 933 aa  261  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  47.69 
 
 		 312 aa  261  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  32.25 
 
 		 925 aa  248  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  31.09 
 
 		 922 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  33.21 
 
 		 1069 aa  244  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  33.21 
 
 		 1069 aa  244  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  31.19 
 
 		 927 aa  239  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  32.42 
 
 		 941 aa  239  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  32.42 
 
 		 941 aa  239  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.8 
 
 		 801 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.83 
 
 		 919 aa  231  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.79 
 
 		 805 aa  229  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  30.69 
 
 		 877 aa  226  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  29.64 
 
 		 937 aa  225  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  32.63 
 
 		 972 aa  223  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  29.61 
 
 		 1031 aa  217  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  30.22 
 
 		 1057 aa  215  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.64 
 
 		 1045 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  32.02 
 
 		 1049 aa  209  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  27.37 
 
 		 1046 aa  209  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.07 
 
 		 952 aa  209  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  29.1 
 
 		 572 aa  206  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  29.58 
 
 		 1082 aa  204  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  29.93 
 
 		 894 aa  202  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  28.55 
 
 		 1058 aa  196  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  30.38 
 
 		 1165 aa  195  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  30.52 
 
 		 953 aa  194  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.48 
 
 		 1028 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  30.96 
 
 		 1095 aa  187  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  31.65 
 
 		 1177 aa  187  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  30.62 
 
 		 1038 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  28.14 
 
 		 949 aa  183  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.29 
 
 		 1201 aa  184  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.29 
 
 		 1201 aa  184  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  30.92 
 
 		 940 aa  179  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  30.33 
 
 		 900 aa  178  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  30.16 
 
 		 948 aa  176  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  28.22 
 
 		 957 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  31.54 
 
 		 1044 aa  175  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  27.93 
 
 		 969 aa  172  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  28.96 
 
 		 963 aa  171  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  31.61 
 
 		 950 aa  170  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  29.17 
 
 		 584 aa  170  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  30.64 
 
 		 933 aa  164  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  27.22 
 
 		 1037 aa  163  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  29.38 
 
 		 964 aa  162  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  30.18 
 
 		 946 aa  162  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  25.52 
 
 		 1065 aa  162  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  25.52 
 
 		 1065 aa  162  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  27.21 
 
 		 968 aa  160  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  27.96 
 
 		 954 aa  159  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  27.91 
 
 		 975 aa  159  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.93 
 
 		 961 aa  158  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  30 
 
 		 955 aa  158  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  28.08 
 
 		 584 aa  157  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  29.18 
 
 		 961 aa  157  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  28.79 
 
 		 986 aa  157  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  25.7 
 
 		 1013 aa  157  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>