More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3305 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  52.28 
 
 		 707 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  77.07 
 
 		 677 aa  1046    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  52.87 
 
 		 701 aa  694    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  50.73 
 
 		 706 aa  656    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  76.44 
 
 		 683 aa  1058    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  51.17 
 
 		 707 aa  684    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  73.89 
 
 		 679 aa  1011    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  79.53 
 
 		 677 aa  1088    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  76.81 
 
 		 678 aa  1044    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  76.78 
 
 		 677 aa  1027    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  79.36 
 
 		 691 aa  1079    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  78.14 
 
 		 689 aa  1075    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  74.11 
 
 		 676 aa  1004    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  79.97 
 
 		 677 aa  1088    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  74.34 
 
 		 680 aa  1003    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  48.32 
 
 		 713 aa  640    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  75.26 
 
 		 684 aa  1008    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 680 aa  1374    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  76.71 
 
 		 687 aa  1010    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  92.35 
 
 		 685 aa  1238    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  79.97 
 
 		 677 aa  1088    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  48.6 
 
 		 699 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  48.3 
 
 		 698 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  47.86 
 
 		 703 aa  608  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  48 
 
 		 698 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  47.41 
 
 		 700 aa  601  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  47.56 
 
 		 698 aa  599  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  48.89 
 
 		 700 aa  556  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  47.14 
 
 		 702 aa  552  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  46.9 
 
 		 705 aa  526  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  44.61 
 
 		 707 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  41.82 
 
 		 730 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 		 726 aa  519  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 		 729 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 689 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 		 680 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 		 730 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  40.45 
 
 		 729 aa  473  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 694 aa  470  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 701 aa  463  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  41.95 
 
 		 700 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  40.47 
 
 		 691 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  40.2 
 
 		 696 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  40.65 
 
 		 695 aa  418  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  31.21 
 
 		 705 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 705 aa  280  5e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 690 aa  280  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  31.08 
 
 		 705 aa  278  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  33.53 
 
 		 684 aa  274  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  32.34 
 
 		 688 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 		 701 aa  264  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 		 688 aa  263  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  31.35 
 
 		 682 aa  262  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  29.58 
 
 		 653 aa  256  9e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  30.47 
 
 		 706 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  29.02 
 
 		 657 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  29.02 
 
 		 657 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  29.69 
 
 		 705 aa  253  6e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 		 705 aa  253  9.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  29.77 
 
 		 705 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  29.49 
 
 		 705 aa  249  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 698 aa  241  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 664 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  29.34 
 
 		 715 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 		 652 aa  223  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  31.93 
 
 		 413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 		 413 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  27.29 
 
 		 571 aa  154  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  38.89 
 
 		 259 aa  150  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 257 aa  144  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 		 257 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  36.76 
 
 		 251 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.32 
 
 		 260 aa  135  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 262 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.365337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 260 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 253 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 		 261 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.55 
 
 		 266 aa  130  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 260 aa  130  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 270 aa  130  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 249 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 263 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 255 aa  128  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.76 
 
 		 270 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 263 aa  127  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 		 260 aa  127  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  37.82 
 
 		 269 aa  127  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 262 aa  127  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  37.25 
 
 		 252 aa  127  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 262 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 269 aa  126  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 274 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 267 aa  126  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 		 268 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16790  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.82 
 
 		 253 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.821391 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4652  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 		 264 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.0540489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  34.11 
 
 		 265 aa  125  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 254 aa  125  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 254 aa  125  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.5 
 
 		 260 aa  125  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>