173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4976 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 154 aa  301  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  45.27 
 
 		 176 aa  117  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 198 aa  110  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 167 aa  102  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  43.18 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  39.67 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  38.13 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  37.21 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  37.69 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  44.21 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  40.95 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  38.26 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  40 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  33.78 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  26.72 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 189 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  31.46 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  38.57 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.92 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  35.38 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  33.82 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4616  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172446  hitchhiker  0.00038288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  33.01 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  34.25 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  35.29 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  33.33 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  28.28 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  29.07 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>