More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2027 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_2027  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
506 aa  958    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.02 
 
 
530 aa  341  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.472299  hitchhiker  0.00171027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 
522 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.01 
 
 
478 aa  237  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.07 
 
 
478 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.07 
 
 
484 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 
478 aa  229  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 
478 aa  229  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.55 
 
 
458 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.12 
 
 
485 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 
525 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.02 
 
 
478 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.08 
 
 
522 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.57 
 
 
488 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.14 
 
 
480 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.16 
 
 
502 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.75 
 
 
508 aa  208  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 
511 aa  206  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 
486 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 
486 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 
486 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 
486 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 
486 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 
486 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
520 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
494 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  32.36 
 
 
537 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.28 
 
 
458 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.92 
 
 
489 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.13 
 
 
490 aa  203  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  36.19 
 
 
469 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 
534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.98 
 
 
503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 
508 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  33.09 
 
 
519 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 
483 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  33.74 
 
 
463 aa  193  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  35.39 
 
 
519 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.12 
 
 
532 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 
516 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.16 
 
 
452 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  34.99 
 
 
582 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  37.56 
 
 
482 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  33.74 
 
 
468 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  33.74 
 
 
468 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.47 
 
 
524 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
502 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.41 
 
 
520 aa  187  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.54 
 
 
519 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  35 
 
 
553 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.06 
 
 
471 aa  187  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.71 
 
 
510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  37.34 
 
 
488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  37.34 
 
 
488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.73 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.33 
 
 
492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.3 
 
 
587 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.06 
 
 
498 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.88 
 
 
469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  37.34 
 
 
479 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.65 
 
 
538 aa  183  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
463 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 
498 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 
520 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.24 
 
 
505 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.06 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.83 
 
 
466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.23 
 
 
489 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.99 
 
 
534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 
607 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 
457 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.62 
 
 
458 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  33.25 
 
 
509 aa  179  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
626 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  35.86 
 
 
476 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  34.92 
 
 
397 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
533 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  35.86 
 
 
476 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  35.86 
 
 
476 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
546 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  35.37 
 
 
523 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  29.55 
 
 
516 aa  176  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
517 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 
488 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.87 
 
 
583 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5160  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.78 
 
 
509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 
523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  39.75 
 
 
477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  35.64 
 
 
517 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
574 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.83 
 
 
500 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.24 
 
 
528 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.65 
 
 
487 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  28.95 
 
 
523 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 
516 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.83 
 
 
508 aa  170  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 
521 aa  170  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  29.78 
 
 
500 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 
763 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.83 
 
 
500 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>