More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1195 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  100 
 
 		 374 aa  753    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  70.11 
 
 		 369 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  55.71 
 
 		 378 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  58.91 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  55.78 
 
 		 381 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  59.21 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  49.73 
 
 		 373 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  48.24 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  48.51 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  46.9 
 
 		 372 aa  361  1e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  52.41 
 
 		 369 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  48.96 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  43.73 
 
 		 374 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  42.67 
 
 		 374 aa  328  7e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  42.71 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  42.35 
 
 		 365 aa  318  7e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  47.16 
 
 		 409 aa  314  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  46.2 
 
 		 689 aa  297  2e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  45.14 
 
 		 688 aa  296  3e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  41.42 
 
 		 370 aa  293  4e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  45.27 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  45.67 
 
 		 393 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  38.79 
 
 		 401 aa  287  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  39.14 
 
 		 403 aa  286  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  38.64 
 
 		 401 aa  285  8e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  41.35 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  38.67 
 
 		 372 aa  278  9e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  42.12 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  38.3 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  42.36 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  40.23 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  38.62 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  38.96 
 
 		 390 aa  252  6e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  37.43 
 
 		 375 aa  252  7e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  39.37 
 
 		 384 aa  250  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  37.77 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  37.77 
 
 		 375 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  36.62 
 
 		 375 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  38.44 
 
 		 386 aa  242  9e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  37.71 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  36.07 
 
 		 376 aa  237  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  36.89 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  38 
 
 		 373 aa  232  9e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  34.15 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  38.3 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  37.53 
 
 		 377 aa  212  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  32.78 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  38.26 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  31.4 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  35.42 
 
 		 344 aa  182  8.000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  31.08 
 
 		 344 aa  125  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 375 aa  123  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  29.86 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  31.76 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  31.29 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  28.23 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29.54 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  28.42 
 
 		 368 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  30.09 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  29.6 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  29.76 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  29.48 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  30.06 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  29.76 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  27.53 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  29.17 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  28.79 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 		 351 aa  102  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  27.41 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  25.68 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.08 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.14 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  29.26 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  24.01 
 
 		 371 aa  99.4  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  26.57 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  29.59 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  29.59 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  29.59 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  26.06 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  27.73 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  26.89 
 
 		 362 aa  96.7  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 353 aa  96.3  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.76 
 
 		 478 aa  96.3  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  23.6 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  25.34 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  27.63 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 353 aa  94.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.06 
 
 		 360 aa  93.6  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  24.6 
 
 		 363 aa  92.8  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  27.86 
 
 		 427 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  27.07 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  29.21 
 
 		 318 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  28.84 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  27.73 
 
 		 349 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>