More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0479 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0479  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
265 aa  507  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  33.78 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  33.92 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  33.92 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
324 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3493  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234814  normal  0.110605 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  33.86 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.43 
 
 
810 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
878 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.17 
 
 
632 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
1178 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  33.05 
 
 
725 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.4 
 
 
622 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.83 
 
 
689 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.38 
 
 
340 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
3145 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.68 
 
 
764 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.19 
 
 
1022 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
589 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
875 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
718 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
1737 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
594 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
637 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
634 aa  55.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
762 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
505 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.27 
 
 
462 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  36.15 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
1421 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
780 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  34.45 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.92 
 
 
818 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
448 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  28.09 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
583 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  38.62 
 
 
626 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.85 
 
 
988 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  37.82 
 
 
714 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
827 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.12 
 
 
706 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
649 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
280 aa  53.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
643 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.71 
 
 
1056 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 
614 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 
614 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
792 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  34.29 
 
 
550 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
681 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
909 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
441 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 
441 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
534 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 
562 aa  52  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  35.96 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  30.47 
 
 
582 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 
776 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  28.33 
 
 
539 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 
566 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  38.2 
 
 
291 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
935 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  26.03 
 
 
321 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.84 
 
 
343 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
614 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  37.93 
 
 
626 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
750 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  37.93 
 
 
614 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
602 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  30.39 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.13 
 
 
784 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  24.14 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  37.93 
 
 
614 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0424  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.0100173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  37.5 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.19 
 
 
626 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  31.39 
 
 
587 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
685 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  29.94 
 
 
545 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  32.39 
 
 
729 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  35.45 
 
 
924 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  31.67 
 
 
334 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
4489 aa  49.7  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
306 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
270 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 
824 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
766 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.37 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31719  peroxisomal targeting signal 1 receptor  32.98 
 
 
712 aa  49.3  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0456101  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
326 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.08 
 
 
676 aa  49.3  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>