More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1021 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 347 aa  702    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  64.49 
 
 		 323 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  30.48 
 
 		 376 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  34.41 
 
 		 356 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 359 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  30.06 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  32.95 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  33.52 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  32.63 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  31.59 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  26.91 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 372 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  30.04 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  32.1 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 151 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  24.85 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.92 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7171  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 211 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 211 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 211 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.25 
 
 		 505 aa  56.2  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.98 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  35.71 
 
 		 210 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 550 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.33 
 
 		 208 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0615  transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 462 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000110739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  48.15 
 
 		 210 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 211 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7170  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 240 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 175 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 176 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 178 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 178 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2775  transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 481 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.257993  normal  0.934511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 275 aa  53.1  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 938 aa  52.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8455  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.81 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0699524  hitchhiker  0.00000314192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1665  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0766  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 501 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 918 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2929  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 462 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.54 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 191 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1314  transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 		 204 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  41.79 
 
 		 929 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1556  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  30.43 
 
 		 216 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 232 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 306 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 215 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 435 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1817  LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.596206  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  43.4 
 
 		 839 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3767  regulatory protein, LuxR  48.15 
 
 		 89 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.163758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 240 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 916 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 222 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 258 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 141 aa  50.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 214 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 215 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0269  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 499 aa  49.7  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 253 aa  49.7  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0133  transcriptional regulator, LuxR family  29.14 
 
 		 480 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.384824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.44 
 
 		 207 aa  49.3  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 904 aa  49.3  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  40.68 
 
 		 913 aa  49.3  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  48.98 
 
 		 967 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 301 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.51 
 
 		 190 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  46.3 
 
 		 227 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 146 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0940527 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  44 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3282  LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 202 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.51 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 919 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>