More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8455 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8455  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 240 aa  471  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0699524  hitchhiker  0.00000314192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  36.82 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 231 aa  121  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  35.85 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0094  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.39 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 303 aa  115  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  35.19 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 218 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  28.5 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  28.5 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  28.5 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  28.5 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  28.5 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  28.5 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 210 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  27.57 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 210 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  28.04 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.11 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000124934  normal  0.0275678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  27.57 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 207 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 216 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1616  response regulator receiver  28.91 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.869432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.84 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 1648 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  30.33 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.63 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  34.09 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.17 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 213 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.13 
 
 		 216 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.6 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 220 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.86 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 218 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2387  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.54 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132486  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 217 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  30.84 
 
 		 228 aa  99  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 212 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.65 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.31 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.03 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  34.72 
 
 		 212 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  31.63 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.72 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>