179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0199 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
165 aa  313  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  44.7 
 
 
172 aa  98.2  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 
168 aa  94.4  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  34.85 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
160 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  39 
 
 
180 aa  58.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
187 aa  55.1  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
189 aa  53.9  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  35.48 
 
 
174 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  35.66 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  22.45 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  57.78 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  31.21 
 
 
292 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  36.17 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 
148 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  35.96 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  55.56 
 
 
185 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 
146 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  30.93 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
156 aa  47.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 
170 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.45 
 
 
143 aa  47.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
162 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
143 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  34.21 
 
 
147 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  34.44 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  48 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  34.04 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
186 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
186 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
139 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
166 aa  44.7  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
181 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
181 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
159 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
159 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
162 aa  44.3  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
155 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
138 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
148 aa  44.3  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 
173 aa  44.3  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
138 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4041  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  50 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  45.83 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>