More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_1800 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1545  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  55.03 
 
 		 750 aa  805    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.405162  normal  0.0471328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1518  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  55.03 
 
 		 750 aa  805    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0549  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  81.02 
 
 		 783 aa  1306    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4503  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  53.32 
 
 		 764 aa  769    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.790425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1911  cold shock protein  50.33 
 
 		 745 aa  683    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.725568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1800  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  100 
 
 		 784 aa  1593    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1511  RNAse R  56.21 
 
 		 766 aa  848    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3422  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  55.84 
 
 		 750 aa  819    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  32.21 
 
 		 706 aa  350  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  30.57 
 
 		 758 aa  333  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  30.59 
 
 		 759 aa  333  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  31.3 
 
 		 770 aa  333  7.000000000000001e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1161  RNA binding S1  33.93 
 
 		 784 aa  328  3e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.140399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  30.54 
 
 		 705 aa  324  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  30.26 
 
 		 762 aa  323  8e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  30.14 
 
 		 763 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  29.51 
 
 		 806 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  29.51 
 
 		 808 aa  317  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  29.51 
 
 		 804 aa  317  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  29.23 
 
 		 814 aa  317  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  29.51 
 
 		 808 aa  317  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  30.25 
 
 		 788 aa  317  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  29.38 
 
 		 808 aa  317  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  29.25 
 
 		 810 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  29.25 
 
 		 806 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  29.11 
 
 		 806 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  28.73 
 
 		 812 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  31.18 
 
 		 777 aa  314  4.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  30.05 
 
 		 857 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  30.19 
 
 		 857 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  30.73 
 
 		 716 aa  312  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09151  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  29.58 
 
 		 760 aa  312  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000238472 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  30.26 
 
 		 751 aa  313  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  30.11 
 
 		 751 aa  312  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  30.05 
 
 		 857 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  28.32 
 
 		 792 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  29.69 
 
 		 763 aa  310  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  31.62 
 
 		 752 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14471  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  30.66 
 
 		 796 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  30.42 
 
 		 757 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  29.61 
 
 		 859 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  28.33 
 
 		 709 aa  301  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  30.93 
 
 		 715 aa  301  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  30.22 
 
 		 706 aa  299  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  29.88 
 
 		 876 aa  298  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  29.43 
 
 		 903 aa  298  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  28.12 
 
 		 792 aa  297  6e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  29.48 
 
 		 790 aa  297  7e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  29.48 
 
 		 790 aa  297  7e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  28.52 
 
 		 828 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  29.99 
 
 		 720 aa  294  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  29.14 
 
 		 827 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  29.14 
 
 		 827 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  29.14 
 
 		 827 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  28.84 
 
 		 937 aa  290  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  27.49 
 
 		 709 aa  290  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  29.87 
 
 		 710 aa  290  8e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  28.75 
 
 		 828 aa  289  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  29.87 
 
 		 710 aa  290  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  28.87 
 
 		 871 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  28.94 
 
 		 877 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  28.89 
 
 		 895 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  29.71 
 
 		 1182 aa  288  4e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  29.21 
 
 		 848 aa  286  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  28.34 
 
 		 812 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  28.34 
 
 		 896 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  28.34 
 
 		 838 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  28.34 
 
 		 817 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  28.34 
 
 		 838 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  28.34 
 
 		 896 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  28.9 
 
 		 876 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  28.34 
 
 		 886 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  28.34 
 
 		 838 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  28.34 
 
 		 817 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1686  ribonuclease R  29.83 
 
 		 818 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  28.9 
 
 		 877 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  28.49 
 
 		 805 aa  283  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  28.69 
 
 		 870 aa  283  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  29.07 
 
 		 864 aa  283  9e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1697  ribonuclease R  28.43 
 
 		 817 aa  282  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892677 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  28.69 
 
 		 749 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  26.51 
 
 		 818 aa  282  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  27.47 
 
 		 801 aa  281  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  28.55 
 
 		 736 aa  280  5e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.55 
 
 		 735 aa  280  7e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  27.72 
 
 		 840 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  28.72 
 
 		 817 aa  279  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  27.58 
 
 		 833 aa  278  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  30.11 
 
 		 716 aa  277  6e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  28.8 
 
 		 758 aa  277  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  26.45 
 
 		 779 aa  276  7e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1271  ribonuclease R  29.5 
 
 		 795 aa  276  8e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142816  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0682  ribonuclease R  29.36 
 
 		 794 aa  276  8e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.43674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  28.18 
 
 		 833 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  29.76 
 
 		 722 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  28.09 
 
 		 808 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  29.23 
 
 		 819 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0360  RNA binding S1:cold shock protein  27.68 
 
 		 765 aa  275  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.2133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  28.14 
 
 		 737 aa  275  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  28.14 
 
 		 737 aa  275  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>