More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2298 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  48.86 
 
 
1499 aa  1036    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  88.42 
 
 
999 aa  1402    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  100 
 
 
1480 aa  2945    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  41.64 
 
 
1156 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  41.32 
 
 
855 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.01 
 
 
2107 aa  506  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  33.33 
 
 
1814 aa  488  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  32.19 
 
 
3598 aa  483  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.14 
 
 
1789 aa  474  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2201  hypothetical protein  95.87 
 
 
265 aa  457  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.139825  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  33.42 
 
 
1607 aa  412  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  36.55 
 
 
940 aa  327  9e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  34.91 
 
 
2954 aa  323  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  29.28 
 
 
2245 aa  281  7e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  30.38 
 
 
1112 aa  250  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  24.62 
 
 
1925 aa  249  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  30.75 
 
 
959 aa  241  8e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  31.47 
 
 
3209 aa  238  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.37 
 
 
4798 aa  234  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  28.03 
 
 
1217 aa  212  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  27.65 
 
 
860 aa  207  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  29.73 
 
 
960 aa  206  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  31.39 
 
 
1383 aa  196  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  26.01 
 
 
1306 aa  189  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.46 
 
 
1079 aa  186  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  52.56 
 
 
1532 aa  174  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  27.91 
 
 
1168 aa  173  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  52.56 
 
 
1534 aa  172  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  31.37 
 
 
5769 aa  171  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.78 
 
 
1363 aa  171  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  31.24 
 
 
3954 aa  163  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.37 
 
 
1180 aa  159  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  28.68 
 
 
2911 aa  159  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  27.61 
 
 
2689 aa  158  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.73 
 
 
946 aa  155  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  30.96 
 
 
4334 aa  153  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  31.37 
 
 
942 aa  152  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.45 
 
 
1279 aa  151  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  30.23 
 
 
1839 aa  150  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.6 
 
 
1400 aa  148  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  30.53 
 
 
1855 aa  140  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  30.64 
 
 
824 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  30.77 
 
 
998 aa  137  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  28.72 
 
 
3026 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  30.51 
 
 
1421 aa  134  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  29.97 
 
 
998 aa  132  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  32.3 
 
 
820 aa  131  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  30.93 
 
 
2775 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  38.6 
 
 
541 aa  129  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  29.68 
 
 
1164 aa  129  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  38.14 
 
 
844 aa  129  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  28.17 
 
 
4723 aa  128  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6493  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  29.72 
 
 
1102 aa  126  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.68 
 
 
1795 aa  125  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  36.15 
 
 
679 aa  125  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.31 
 
 
1197 aa  125  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  31.01 
 
 
965 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  38.54 
 
 
2667 aa  124  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.49 
 
 
2678 aa  123  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  30.2 
 
 
856 aa  122  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  28.85 
 
 
692 aa  121  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  31.03 
 
 
556 aa  121  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  71.08 
 
 
435 aa  121  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.12 
 
 
980 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  29.81 
 
 
1884 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.29 
 
 
1403 aa  115  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  26.18 
 
 
2467 aa  115  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  38.76 
 
 
582 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  28.39 
 
 
1544 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2509  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.36 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.70233  normal  0.227356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  30.86 
 
 
858 aa  112  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  38.76 
 
 
585 aa  112  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.59 
 
 
1415 aa  111  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  31.38 
 
 
889 aa  111  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  31.49 
 
 
901 aa  111  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  33.64 
 
 
928 aa  111  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  32.28 
 
 
950 aa  109  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  29.4 
 
 
595 aa  109  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  29.34 
 
 
4800 aa  108  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  44.09 
 
 
466 aa  107  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  27.98 
 
 
833 aa  107  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  27.26 
 
 
2836 aa  107  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.82 
 
 
3427 aa  108  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  32.18 
 
 
515 aa  107  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  38.35 
 
 
1019 aa  107  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  29.55 
 
 
928 aa  106  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.82 
 
 
1236 aa  106  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4222  hypothetical protein  30.37 
 
 
369 aa  105  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  32.24 
 
 
1712 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  33.43 
 
 
460 aa  104  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  45.21 
 
 
1809 aa  103  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  30.84 
 
 
4687 aa  103  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  31.3 
 
 
518 aa  102  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  27.38 
 
 
928 aa  102  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  34.12 
 
 
2105 aa  101  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  35.26 
 
 
341 aa  101  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  32.93 
 
 
1424 aa  101  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  36 
 
 
618 aa  100  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  35.51 
 
 
475 aa  100  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  31.96 
 
 
833 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>