240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1153 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  61.27 
 
 		 785 aa  809    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  57.07 
 
 		 973 aa  827    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  56.9 
 
 		 1478 aa  757    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  58.72 
 
 		 984 aa  745    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  64.37 
 
 		 854 aa  894    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  57.89 
 
 		 894 aa  745    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  53.4 
 
 		 1121 aa  875    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  52.06 
 
 		 741 aa  636    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  60.57 
 
 		 966 aa  774    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  73.25 
 
 		 842 aa  981    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  60.9 
 
 		 963 aa  776    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  58.54 
 
 		 854 aa  768    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  56.9 
 
 		 1759 aa  756    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  56.64 
 
 		 974 aa  774    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  100 
 
 		 900 aa  1805    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.59 
 
 		 919 aa  700    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  55.16 
 
 		 722 aa  707    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  61.74 
 
 		 979 aa  822    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  56.9 
 
 		 1904 aa  754    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.1 
 
 		 938 aa  611  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  90.78 
 
 		 655 aa  330  7e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  52.33 
 
 		 649 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  48 
 
 		 523 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  46.78 
 
 		 443 aa  127  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  48.3 
 
 		 543 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  45.19 
 
 		 658 aa  122  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  43 
 
 		 847 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  43.98 
 
 		 608 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  45.21 
 
 		 681 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  39.13 
 
 		 880 aa  105  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.34 
 
 		 998 aa  103  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  46.43 
 
 		 978 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  34.83 
 
 		 674 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  34.33 
 
 		 674 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  42.64 
 
 		 743 aa  99  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.84 
 
 		 674 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  31.84 
 
 		 674 aa  95.1  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  31.84 
 
 		 674 aa  95.1  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  31.84 
 
 		 674 aa  95.1  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  37.5 
 
 		 460 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  31.34 
 
 		 674 aa  94  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  31.84 
 
 		 674 aa  93.6  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  51.69 
 
 		 820 aa  92.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  30.85 
 
 		 674 aa  92.8  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  31.34 
 
 		 674 aa  92.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  55.56 
 
 		 468 aa  91.7  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  42.55 
 
 		 429 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  48.48 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  52.81 
 
 		 313 aa  85.9  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  52.17 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  37.95 
 
 		 543 aa  82.8  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  37.57 
 
 		 637 aa  82.8  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  48.91 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  47.83 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  47.83 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  48.31 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  48.31 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  49.47 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  46.74 
 
 		 455 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  43.28 
 
 		 924 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  46.36 
 
 		 1887 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  49.45 
 
 		 455 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  50 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  46.74 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  48.31 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  51.69 
 
 		 1154 aa  78.2  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  45.65 
 
 		 455 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  45.65 
 
 		 455 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  45.65 
 
 		 455 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  45.74 
 
 		 787 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  46.81 
 
 		 749 aa  77  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  44.57 
 
 		 455 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 		 674 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  48.94 
 
 		 702 aa  75.5  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 1137 aa  75.5  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  42.57 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  47.06 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  34.57 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  48.94 
 
 		 809 aa  74.3  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  45.61 
 
 		 2170 aa  74.3  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  46.91 
 
 		 368 aa  73.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  39.2 
 
 		 727 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  44.68 
 
 		 660 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  48.31 
 
 		 490 aa  72.8  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.04 
 
 		 795 aa  72  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  50.6 
 
 		 454 aa  72  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  49.46 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  51.25 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  48 
 
 		 449 aa  70.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  45.36 
 
 		 493 aa  70.1  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.83 
 
 		 729 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  41.05 
 
 		 456 aa  70.1  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  42.55 
 
 		 422 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  33.83 
 
 		 459 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  49.43 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.86 
 
 		 6885 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  46.32 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  43.14 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  44.57 
 
 		 854 aa  68.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  46.94 
 
 		 673 aa  68.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>