More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4582 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
452 aa  886  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  60.19 
 
 
463 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  53.53 
 
 
468 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  53.53 
 
 
468 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  55.73 
 
 
463 aa  439  1e-122  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  2.85964e-05 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  53.12 
 
 
468 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  54.97 
 
 
397 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.9 
 
 
469 aa  310  3e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  43.1 
 
 
523 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  38.87 
 
 
511 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  38.87 
 
 
511 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  38.62 
 
 
514 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  38.87 
 
 
511 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  38.87 
 
 
511 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  42.61 
 
 
480 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  42.12 
 
 
483 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  42.12 
 
 
483 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  42.61 
 
 
482 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  43.99 
 
 
494 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 
457 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  43.23 
 
 
477 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2073  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  38.4 
 
 
561 aa  270  6e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132683  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  41.09 
 
 
474 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  43.18 
 
 
488 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  43.18 
 
 
488 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  43.18 
 
 
479 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.56 
 
 
480 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 
483 aa  253  5e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.01 
 
 
478 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  6.83759e-05 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.97 
 
 
522 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 
478 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.38 
 
 
484 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.83 
 
 
478 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.04 
 
 
502 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.59 
 
 
478 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  37.01 
 
 
469 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.55 
 
 
478 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.78 
 
 
489 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 
486 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 
486 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 
486 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 
486 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 
486 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 
486 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 
485 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.98 
 
 
488 aa  235  1e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35 
 
 
508 aa  234  2e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  41.48 
 
 
455 aa  232  8e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 
505 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.95 
 
 
466 aa  229  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.48 
 
 
478 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.69 
 
 
524 aa  226  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.59 
 
 
763 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  35.75 
 
 
476 aa  223  5e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  35.56 
 
 
476 aa  223  5e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  35.02 
 
 
523 aa  223  5e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  35.56 
 
 
476 aa  223  5e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.48 
 
 
458 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 
510 aa  220  4e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.92 
 
 
489 aa  220  4e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.61 
 
 
469 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.54 
 
 
529 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1585  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 
492 aa  219  8e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  35.45 
 
 
537 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.16 
 
 
490 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.97 
 
 
500 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.83 
 
 
458 aa  216  6e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.56 
 
 
520 aa  216  8e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.48 
 
 
500 aa  215  1e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.16 
 
 
522 aa  215  1e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0408  major facilitator superfamily MFS_1  37.26 
 
 
487 aa  215  1e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.417643 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.14 
 
 
520 aa  214  2e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5842  major facilitator transporter  34.92 
 
 
456 aa  215  2e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  35 
 
 
528 aa  215  2e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2892  major facilitator transporter  35.79 
 
 
477 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1455  major facilitator transporter  36.91 
 
 
443 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.17 
 
 
506 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.27 
 
 
539 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 
505 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.13 
 
 
476 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 
516 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 
506 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  35.59 
 
 
450 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.85 
 
 
492 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 
540 aa  204  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 
506 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 
506 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.31 
 
 
471 aa  204  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  38.29 
 
 
497 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 
485 aa  203  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.3 
 
 
538 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.46 
 
 
502 aa  202  1e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4168  major facilitator transporter  37.26 
 
 
474 aa  201  2e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.55276  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 
527 aa  201  2e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 
528 aa  201  2e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5226  major facilitator transporter  33.77 
 
 
478 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.15 
 
 
505 aa  199  1e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
520 aa  198  1e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.92 
 
 
532 aa  199  1e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 
516 aa  199  1e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>