More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0061 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  100 
 
 		 736 aa  1485    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.76 
 
 		 734 aa  644    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.93 
 
 		 743 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  46.25 
 
 		 736 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.3 
 
 		 738 aa  599  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  44.2 
 
 		 740 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.16 
 
 		 744 aa  571  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.66 
 
 		 740 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  44.92 
 
 		 734 aa  555  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  42.66 
 
 		 743 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.47 
 
 		 783 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  42.51 
 
 		 723 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.81 
 
 		 725 aa  485  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.97 
 
 		 755 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  38.51 
 
 		 751 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.06 
 
 		 739 aa  422  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  36.64 
 
 		 746 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  32.53 
 
 		 740 aa  389  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  32.19 
 
 		 722 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.6 
 
 		 711 aa  369  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.99 
 
 		 741 aa  364  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.54 
 
 		 710 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.43 
 
 		 708 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.5 
 
 		 716 aa  299  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.93 
 
 		 696 aa  279  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  29.78 
 
 		 925 aa  244  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  29.78 
 
 		 925 aa  243  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.4 
 
 		 716 aa  236  9e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.4 
 
 		 706 aa  227  7e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.52 
 
 		 931 aa  220  6e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.68 
 
 		 701 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.69 
 
 		 711 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.41 
 
 		 698 aa  213  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  31.79 
 
 		 710 aa  207  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  30.76 
 
 		 939 aa  207  7e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.11 
 
 		 972 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.96 
 
 		 694 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.16 
 
 		 933 aa  197  7e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.16 
 
 		 711 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.83 
 
 		 696 aa  190  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  27.7 
 
 		 955 aa  188  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  30.85 
 
 		 694 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.72 
 
 		 913 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.07 
 
 		 675 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.3 
 
 		 913 aa  183  9.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  30.84 
 
 		 753 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.16 
 
 		 890 aa  181  4.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.75 
 
 		 916 aa  179  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.02 
 
 		 903 aa  178  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.7 
 
 		 909 aa  177  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.21 
 
 		 926 aa  176  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.76 
 
 		 897 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.39 
 
 		 944 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  27.82 
 
 		 943 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  31.45 
 
 		 702 aa  174  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  27.83 
 
 		 946 aa  173  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  27.03 
 
 		 898 aa  173  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.26 
 
 		 928 aa  169  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  26.79 
 
 		 954 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.2 
 
 		 928 aa  169  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.5 
 
 		 927 aa  167  8e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.91 
 
 		 970 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.51 
 
 		 916 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  28.07 
 
 		 903 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.14 
 
 		 1412 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.26 
 
 		 932 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  32.64 
 
 		 1688 aa  162  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  27.99 
 
 		 873 aa  160  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  29.83 
 
 		 888 aa  159  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  30.73 
 
 		 875 aa  158  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.33 
 
 		 912 aa  158  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.51 
 
 		 937 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.59 
 
 		 905 aa  157  8e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.6 
 
 		 915 aa  152  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  30.83 
 
 		 922 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.77 
 
 		 854 aa  151  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  32.19 
 
 		 872 aa  151  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.49 
 
 		 1505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  29.15 
 
 		 1448 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  31.83 
 
 		 1448 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.12 
 
 		 1426 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  24.92 
 
 		 820 aa  147  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.85 
 
 		 1480 aa  147  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.21 
 
 		 1497 aa  146  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.82 
 
 		 1476 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.1 
 
 		 1626 aa  146  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.86 
 
 		 874 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  32.96 
 
 		 1515 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  28.42 
 
 		 1567 aa  144  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.02 
 
 		 1429 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 824 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.1 
 
 		 874 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.24 
 
 		 1508 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.18 
 
 		 900 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  30.71 
 
 		 1434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.13 
 
 		 819 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.99 
 
 		 1700 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  28.35 
 
 		 874 aa  142  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  27.99 
 
 		 1435 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  27.5 
 
 		 1523 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>