89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1431 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  100 
 
 
208 aa  400  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  46.96 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  46.76 
 
 
222 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  46.15 
 
 
219 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  38.76 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  35.48 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  42.99 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  37.93 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3506  restriction endonuclease  35.51 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  43.4 
 
 
359 aa  68.6  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  35.9 
 
 
421 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5134  restriction endonuclease  30.26 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360848  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  35.14 
 
 
520 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  36.22 
 
 
291 aa  62  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  42.11 
 
 
368 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  34.73 
 
 
285 aa  58.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  30.97 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  34.13 
 
 
287 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  31.54 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  35.35 
 
 
450 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  33.59 
 
 
1291 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  32.52 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  36.08 
 
 
447 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  31.43 
 
 
271 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  32.41 
 
 
799 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  36.89 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  32.41 
 
 
799 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  30.89 
 
 
182 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  38.21 
 
 
296 aa  52.4  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  30.84 
 
 
299 aa  52  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  38.74 
 
 
233 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  38.74 
 
 
233 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  34.92 
 
 
288 aa  51.2  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  38.74 
 
 
233 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  35.24 
 
 
260 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  35.24 
 
 
260 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0711  restriction endonuclease  37.61 
 
 
168 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000595924  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  34.04 
 
 
345 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  35.85 
 
 
355 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  29.81 
 
 
305 aa  49.7  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  36.56 
 
 
300 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  38.83 
 
 
286 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  36.22 
 
 
374 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  33.33 
 
 
333 aa  48.5  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  30.67 
 
 
297 aa  48.5  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  35.19 
 
 
230 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  30.94 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  29.59 
 
 
145 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  30.94 
 
 
291 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  36.19 
 
 
349 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  34.41 
 
 
302 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  36.96 
 
 
338 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  32.04 
 
 
342 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  30.39 
 
 
330 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  38.26 
 
 
454 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  32.04 
 
 
271 aa  46.2  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  28.95 
 
 
305 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  34.29 
 
 
249 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  35 
 
 
453 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  37.8 
 
 
325 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  31.97 
 
 
296 aa  45.4  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  33.05 
 
 
301 aa  45.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  28.43 
 
 
363 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  28.57 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  34.29 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  28 
 
 
313 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  38.95 
 
 
306 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  31.03 
 
 
455 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  31.68 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  35.09 
 
 
310 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  34.82 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  28.07 
 
 
302 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  29.23 
 
 
349 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  29.87 
 
 
152 aa  42.7  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  31.68 
 
 
454 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  31.68 
 
 
454 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  31.63 
 
 
440 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  35.45 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  29.07 
 
 
144 aa  42.4  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  35.92 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  32.69 
 
 
247 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  34.03 
 
 
313 aa  42  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  36.89 
 
 
281 aa  42  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  32.46 
 
 
289 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  31.63 
 
 
327 aa  42  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  30.95 
 
 
348 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  30.16 
 
 
293 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  30 
 
 
326 aa  42  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  33.64 
 
 
493 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>