230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0095 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  40.97 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 250 aa  148  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 261 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 283 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  26.64 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  24.89 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  26.52 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  24.35 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  25.25 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 206 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 197 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  35.05 
 
 		 196 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  25.55 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 205 aa  49.3  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 208 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  34.25 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  43.33 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 410 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  23.01 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 221 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>