More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0381 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  72.64 
 
 		 605 aa  825    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  66.67 
 
 		 602 aa  772    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  100 
 
 		 601 aa  1164    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  87.89 
 
 		 605 aa  1010    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  66.78 
 
 		 602 aa  776    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  73.72 
 
 		 609 aa  840    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  66.67 
 
 		 602 aa  773    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  67.71 
 
 		 602 aa  742    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  73.01 
 
 		 605 aa  825    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  75.83 
 
 		 606 aa  823    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  40.6 
 
 		 596 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  40.6 
 
 		 602 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  41.67 
 
 		 597 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  38.68 
 
 		 596 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  39.06 
 
 		 596 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  34.41 
 
 		 622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  36.6 
 
 		 623 aa  327  3e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  36.15 
 
 		 627 aa  318  3e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  33.91 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  33.1 
 
 		 592 aa  286  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  33.16 
 
 		 591 aa  283  9e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  33.74 
 
 		 592 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  33.22 
 
 		 588 aa  280  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  32.77 
 
 		 588 aa  280  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  33.16 
 
 		 592 aa  279  9e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  34.38 
 
 		 588 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  34.61 
 
 		 612 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  34.17 
 
 		 609 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 588 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  31.92 
 
 		 592 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  31.92 
 
 		 592 aa  273  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  32.36 
 
 		 593 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  31.92 
 
 		 589 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  32.94 
 
 		 592 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.61 
 
 		 596 aa  269  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  32.94 
 
 		 592 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  31.75 
 
 		 592 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.74 
 
 		 616 aa  266  5.999999999999999e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  32.44 
 
 		 589 aa  266  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  31.53 
 
 		 599 aa  262  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  33.8 
 
 		 574 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  30.96 
 
 		 588 aa  261  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.33 
 
 		 613 aa  256  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  34.02 
 
 		 587 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.72 
 
 		 618 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  33.74 
 
 		 598 aa  253  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  33.21 
 
 		 574 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  30.56 
 
 		 607 aa  251  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  32.82 
 
 		 613 aa  251  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  30.41 
 
 		 593 aa  250  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  35.28 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  34 
 
 		 599 aa  249  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  29.61 
 
 		 596 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  33.39 
 
 		 591 aa  247  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  32.77 
 
 		 592 aa  246  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  33.21 
 
 		 574 aa  246  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  30.05 
 
 		 624 aa  244  3e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  32.4 
 
 		 574 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  32.22 
 
 		 579 aa  240  5e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  31.75 
 
 		 609 aa  240  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  30.58 
 
 		 616 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  29.54 
 
 		 593 aa  238  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  31.22 
 
 		 619 aa  237  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.47 
 
 		 609 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  31.3 
 
 		 609 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  32.03 
 
 		 575 aa  233  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  31.41 
 
 		 574 aa  233  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  31.35 
 
 		 575 aa  231  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  30.49 
 
 		 583 aa  229  8e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  32.25 
 
 		 574 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  31.53 
 
 		 588 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  31.3 
 
 		 609 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  27.48 
 
 		 590 aa  228  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  31.3 
 
 		 609 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  27.84 
 
 		 619 aa  228  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  30.93 
 
 		 587 aa  226  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  27.66 
 
 		 590 aa  226  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  33.05 
 
 		 574 aa  225  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  29.56 
 
 		 588 aa  224  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  32.79 
 
 		 574 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  33.16 
 
 		 574 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  29.1 
 
 		 588 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  32.08 
 
 		 574 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  29.51 
 
 		 634 aa  221  3e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  31.59 
 
 		 575 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  31.02 
 
 		 591 aa  221  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  32.08 
 
 		 574 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  32.92 
 
 		 574 aa  220  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  31.16 
 
 		 618 aa  220  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  30.88 
 
 		 609 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  29.27 
 
 		 588 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  30.35 
 
 		 621 aa  217  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  28.14 
 
 		 591 aa  216  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  30.69 
 
 		 593 aa  216  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  30.3 
 
 		 575 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  28.17 
 
 		 593 aa  215  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  30.41 
 
 		 583 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  29.45 
 
 		 575 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  31.85 
 
 		 627 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  30.86 
 
 		 591 aa  211  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>