299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2953 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 773 aa  1595    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.68 
 
 		 1061 aa  326  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.23 
 
 		 440 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.8 
 
 		 432 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.55 
 
 		 446 aa  167  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  35.45 
 
 		 403 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 628 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.41 
 
 		 428 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.67 
 
 		 632 aa  130  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.04 
 
 		 626 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.76 
 
 		 439 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  29.73 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  38.54 
 
 		 1565 aa  114  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.82 
 
 		 378 aa  112  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  42.22 
 
 		 1150 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.4 
 
 		 1034 aa  94.4  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.43 
 
 		 1034 aa  94.4  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  27.04 
 
 		 429 aa  93.6  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  38.04 
 
 		 623 aa  90.9  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  37.91 
 
 		 816 aa  88.2  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  34.5 
 
 		 1916 aa  84.3  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.19 
 
 		 3197 aa  84  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  38.37 
 
 		 938 aa  82  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  37.02 
 
 		 2066 aa  81.6  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.42 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.86 
 
 		 3197 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.42 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  36.98 
 
 		 869 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.8 
 
 		 1074 aa  78.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  35.06 
 
 		 938 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  31.63 
 
 		 873 aa  77.8  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  33.52 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  32.65 
 
 		 820 aa  76.6  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  41.24 
 
 		 943 aa  77.4  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.03 
 
 		 889 aa  75.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  33.79 
 
 		 734 aa  75.5  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  24.59 
 
 		 752 aa  75.1  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  31.82 
 
 		 1057 aa  75.1  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.18 
 
 		 824 aa  74.3  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  34.59 
 
 		 951 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  32.14 
 
 		 868 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  32.14 
 
 		 868 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  34.86 
 
 		 965 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  31.63 
 
 		 868 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  26.89 
 
 		 1862 aa  68.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  28.57 
 
 		 1732 aa  69.3  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  24.15 
 
 		 3295 aa  68.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  29.44 
 
 		 1151 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  31.95 
 
 		 1027 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  33.76 
 
 		 935 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  27.68 
 
 		 1667 aa  68.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  31.75 
 
 		 868 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  32.28 
 
 		 868 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  27.32 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  25.73 
 
 		 658 aa  67.8  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.69 
 
 		 2272 aa  67.8  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  32.28 
 
 		 868 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.66 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.66 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.66 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  26.94 
 
 		 2122 aa  67  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  26.89 
 
 		 815 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  30 
 
 		 910 aa  67.4  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  25 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  24.88 
 
 		 713 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  27.49 
 
 		 575 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  28.86 
 
 		 1095 aa  66.6  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  30.51 
 
 		 1292 aa  66.6  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  31.22 
 
 		 867 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  29.38 
 
 		 528 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.07 
 
 		 940 aa  66.6  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  33.85 
 
 		 863 aa  65.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  25.37 
 
 		 675 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  26.47 
 
 		 2000 aa  65.1  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  29.89 
 
 		 972 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  25.12 
 
 		 735 aa  64.7  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  26.11 
 
 		 821 aa  64.7  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  29.77 
 
 		 848 aa  64.7  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  30.91 
 
 		 1842 aa  64.3  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  34.4 
 
 		 936 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  27.62 
 
 		 2554 aa  63.9  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  34.4 
 
 		 936 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  26.73 
 
 		 561 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  46.43 
 
 		 780 aa  63.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  27.59 
 
 		 1356 aa  63.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  32.54 
 
 		 855 aa  63.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1682 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  25.62 
 
 		 1094 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  30 
 
 		 1120 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1667 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  26.2 
 
 		 1528 aa  62.4  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  30.3 
 
 		 786 aa  61.6  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  26.39 
 
 		 978 aa  61.6  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  33.6 
 
 		 719 aa  61.6  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  28.65 
 
 		 918 aa  61.6  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.18 
 
 		 942 aa  61.2  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.94 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  23.65 
 
 		 685 aa  61.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  24.15 
 
 		 859 aa  61.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  30.72 
 
 		 861 aa  60.8  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>